GSE298818：DDR1调控RUNX1-CBFβ控制乳腺干细胞分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298818

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数据说明

了解乳腺组织发育过程中上皮干细胞的分化与形态发生至关重要，因为这些过程的紊乱是乳腺癌形成的基础。近期研究表明，上皮干细胞和祖细胞利用胶原受体盘状结构域受体1（DDR1）分化为基底细胞和管腔细胞谱系，二者共同参与复杂的导管-小叶形态发生。在本研究中，我们采用下一代单细胞来源的类器官模型——该模型可生成微型化乳腺组织——来研究单个干细胞如何产生多种细胞类型和复合组织结构。我们发现，抑制DDR1会使细胞停滞在双潜能状态，阻断肺泡形态发生以及复杂上皮形成所需的管腔细胞扩增。破坏RUNX1功能产生了几乎相同的表型，凸显了其在DDR1下游的关键作用。在机制上，DDR1影响RUNX1及其辅因子CBFβ的相互作用和表达，从而调控其活性。

乳腺癌患者的突变分析显示，DDR1-RUNX1信号轴频繁发生改变，尤其是共现突变。综合这些发现，DDR1-RUNX1被揭示为驱动乳腺上皮分化的核心信号通路，其失调可能在根本上促进乳腺癌的发病机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。