阻断APE1与G-四链体相互作用抑制三阴性乳腺癌转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297827

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）是最具侵袭性和高度转移性的乳腺癌。近期全基因组分析发现，在与转移性TNBC相关的基因启动子和增强子区域中，非经典四链DNA二级结构——G-四链体（G4）存在显著改变。然而，G4 DNA与TNBC转移之间的机制联系仍不清楚。利用CRISPR技术在TNBC细胞内源基因启动子处基因消融G4折叠，我们证明CXCL1基因启动子中G4结构的缺失显著降低CXCL1表达，从而导致细胞迁移和侵袭以及体内肿瘤发生和肺转移的显著减少。在机制上，G4招募APE1，这是一种多功能蛋白，通过其氧化还原效应功能增强转录因子结合，并激活关键转移相关基因。此外，APE1缺失或用G4配体TMPyP4破坏其与G4的结合，可抑制基因表达、肿瘤生长和肺转移。

我们的研究首次提供了G4在肿瘤进展和转移中作用的遗传学证据，并确定了G4:APE1轴作为靶向三阴性乳腺癌原发肿瘤和转移的新治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。