小鼠乳腺癌模型MMTV-PyMT中正常乳腺成纤维细胞与癌相关成纤维细胞在RNAi干扰Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析

该数据集来自NCBI GEO,包含MMTV-PyMT小鼠乳腺癌模型中正常乳腺成纤维细胞(NFs)与癌相关成纤维细胞(CAFs)在通过RNAi扰动Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析,采用高通量测序,平台为GPL17021,物种为小鼠(10090),共1个文件

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时间序列分类GPL1702110090
GSE296064: Gene expression analysis of normal mammary gland fibroblasts (NFs) and cancer-associated fibroblasts (CAFs) from the murine breast cancer model MMTV-PyMT after perturbing the expression of Hsp90aa1 and Hsp90ab1 by RNAi

基本信息

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创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

小鼠乳腺癌模型MMTV-PyMT中正常乳腺成纤维细胞与癌相关成纤维细胞在RNAi干扰Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析

Gene expression analysis of normal mammary gland fibroblasts (NFs) and cancer-associated fibroblasts (CAFs) from the murine breast cancer model MMTV-PyMT after perturbing the expression of Hsp90aa1 and Hsp90ab1 by RNAi

该数据集来自NCBI GEO,包含MMTV-PyMT小鼠乳腺癌模型中正常乳腺成纤维细胞(NFs)与癌相关成纤维细胞(CAFs)在通过RNAi扰动Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析,采用高通量测序,平台为GPL17021,物种为小鼠(10090),共1个文件。数据可用于研究HSP90在肿瘤基质成纤维细胞中的功能,特别是HSP90α对CAF重塑细胞外基质、维持TGFβ应答和YAP水平以及促进肿瘤生长和转移的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症通过适应蛋白质稳态来应对错误折叠蛋白的负担,稳定关键信号节点并维持其恶性行为。肿瘤基质也承受类似的压力,但这些压力如何影响其异常状态仍不清楚。我们发现肿瘤基质中与主要错误折叠调节因子HSP90相关的靶基因在癌相关成纤维细胞(CAFs)中持续上调,并且HSP90α是CAFs重塑细胞外基质(ECM)以及促进癌细胞运动和生长所必需的。机制上,HSP90α维持CAF功能所需的TGFβ应答和YAP蛋白水平。在体内,基质或成纤维细胞特异性缺失HSP90α会导致乳腺肿瘤的ECM沉积、血管生成、生长和播散减少。临床分析揭示CAFs中HSP90依赖程序与YAP活性之间存在相关性,这些

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL17021、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296064

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症通过适应蛋白质稳态来应对错误折叠蛋白的负担,稳定关键信号节点并维持其恶性行为。肿瘤基质也承受类似的压力,但这些压力如何影响其异常状态仍不清楚。我们发现,肿瘤基质中与主要错误折叠调节因子HSP90相关的靶基因在癌症相关成纤维细胞(CAFs)中持续上调,且HSP90α是CAFs重塑细胞外基质(ECM)并促进癌细胞运动和生长所必需的。机制上,HSP90α维持CAF功能所需的TGFβ反应和YAP蛋白水平。在体内,基质或成纤维细胞特异性缺失HSP90α会导致乳腺肿瘤的ECM沉积、血管生成、生长和播散减少。临床分析揭示了CAFs中HSP90依赖性程序与YAP活性之间的相关性,这也与患者不良预后相关。我们的发现揭示了通过HSP90α在蛋白质稳态、机械转导和侵袭性肿瘤微环境生成之间的联系。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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