小鼠乳腺癌模型MMTV-PyMT中正常乳腺成纤维细胞与癌相关成纤维细胞在RNAi干扰Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析
该数据集来自NCBI GEO,包含MMTV-PyMT小鼠乳腺癌模型中正常乳腺成纤维细胞(NFs)与癌相关成纤维细胞(CAFs)在通过RNAi扰动Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析,采用高通量测序,平台为GPL17021,物种为小鼠(10090),共1个文件

基本信息
资源简介
小鼠乳腺癌模型MMTV-PyMT中正常乳腺成纤维细胞与癌相关成纤维细胞在RNAi干扰Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析
Gene expression analysis of normal mammary gland fibroblasts (NFs) and cancer-associated fibroblasts (CAFs) from the murine breast cancer model MMTV-PyMT after perturbing the expression of Hsp90aa1 and Hsp90ab1 by RNAi
该数据集来自NCBI GEO,包含MMTV-PyMT小鼠乳腺癌模型中正常乳腺成纤维细胞(NFs)与癌相关成纤维细胞(CAFs)在通过RNAi扰动Hsp90aa1和Hsp90ab1表达后的基因表达分析,采用高通量测序,平台为GPL17021,物种为小鼠(10090),共1个文件。数据可用于研究HSP90在肿瘤基质成纤维细胞中的功能,特别是HSP90α对CAF重塑细胞外基质、维持TGFβ应答和YAP水平以及促进肿瘤生长和转移的作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 30 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症通过适应蛋白质稳态来应对错误折叠蛋白的负担,稳定关键信号节点并维持其恶性行为。肿瘤基质也承受类似的压力,但这些压力如何影响其异常状态仍不清楚。我们发现肿瘤基质中与主要错误折叠调节因子HSP90相关的靶基因在癌相关成纤维细胞(CAFs)中持续上调,并且HSP90α是CAFs重塑细胞外基质(ECM)以及促进癌细胞运动和生长所必需的。机制上,HSP90α维持CAF功能所需的TGFβ应答和YAP蛋白水平。在体内,基质或成纤维细胞特异性缺失HSP90α会导致乳腺肿瘤的ECM沉积、血管生成、生长和播散减少。临床分析揭示CAFs中HSP90依赖程序与YAP活性之间存在相关性,这些
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL17021、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296064
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296064
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
癌症通过适应蛋白质稳态来应对错误折叠蛋白的负担,稳定关键信号节点并维持其恶性行为。肿瘤基质也承受类似的压力,但这些压力如何影响其异常状态仍不清楚。我们发现,肿瘤基质中与主要错误折叠调节因子HSP90相关的靶基因在癌症相关成纤维细胞(CAFs)中持续上调,且HSP90α是CAFs重塑细胞外基质(ECM)并促进癌细胞运动和生长所必需的。机制上,HSP90α维持CAF功能所需的TGFβ反应和YAP蛋白水平。在体内,基质或成纤维细胞特异性缺失HSP90α会导致乳腺肿瘤的ECM沉积、血管生成、生长和播散减少。临床分析揭示了CAFs中HSP90依赖性程序与YAP活性之间的相关性,这也与患者不良预后相关。我们的发现揭示了通过HSP90α在蛋白质稳态、机械转导和侵袭性肿瘤微环境生成之间的联系。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




