Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq数据(MCF7)
该数据集来自NCBI GEO,标题为Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq_MCF7研究,包含1个文件(GSE294974_series_matrix.txt.gz),属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为GPL24676
![GSE294974: Pin1 mediates immune evasion in fibrotic breast cancers via suppression of Transposable Elements [RNAseq_MCF7]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/140328.jpg)
基本信息
资源简介
Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq数据(MCF7)
Pin1 mediates immune evasion in fibrotic breast cancers via suppression of Transposable Elements [RNAseq_MCF7]
该数据集来自NCBI GEO,标题为Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq_MCF7研究,包含1个文件(GSE294974_series_matrix.txt.gz),属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为GPL24676。数据可用于研究Pin1在纤维化乳腺癌免疫抑制中的作用、转座子激活与cGAS/STING/IFN-I通路的关系,以及基于表达谱的肿瘤免疫微环境分类分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 17 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症中的治疗耐药性常由肿瘤异质性和免疫抑制性肿瘤微环境驱动,尤其是在细胞外基质(ECM)僵硬的纤维化肿瘤中。然而,ECM硬度与免疫逃逸之间的联系机制仍知之甚少。在此,我们确定脯氨酰异构酶Pin1是纤维化乳腺癌中免疫抑制的核心介质。ECM硬化稳定Pin1并驱动其核积累,在核内它维持核膜NE和异染色质HC的完整性,从而阻止cGAS/STING/IFN-I通路的激活。抑制Pin1会破坏NE和HC结构,重新激活转座子(TEs),并通过TE衍生的新抗原诱导先天性和适应性免疫应答。在原发BC和转移灶的临床前模型中,Pin1缺失触发免疫细胞浸润,将免疫冷肿瘤转化为
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294974
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 13 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
癌症治疗耐药常由肿瘤异质性和免疫抑制性肿瘤微环境驱动,尤其在具有僵硬细胞外基质(ECM)的纤维化肿瘤中更为突出。然而,ECM硬度与免疫逃逸之间的关联机制仍知之甚少。在此,我们鉴定出脯氨酰异构酶Pin1是纤维化乳腺癌中免疫抑制的核心介导因子。ECM硬化可稳定Pin1并驱动其核内积聚,在核内Pin1维持核膜(NE)和异染色质(HC)完整性,从而阻止cGAS/STING/IFN-I通路的激活。抑制Pin1可破坏NE和HC结构,重新激活转座元件(TEs),并通过TE衍生的新抗原诱导先天性和适应性免疫应答。在原发性乳腺癌及转移灶的临床前模型中,Pin1缺失可触发免疫细胞浸润,将免疫“冷”肿瘤转化为对免疫检查点阻断敏感的肿瘤。这些发现揭示了一种机械敏感的免疫逃逸机制,并确立Pin1作为增强纤维化癌症免疫治疗疗效的有前景的治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




