Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq数据(MCF7)

该数据集来自NCBI GEO,标题为Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq_MCF7研究,包含1个文件(GSE294974_series_matrix.txt.gz),属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为GPL24676

geo
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基因组分类GPL246769606
GSE294974: Pin1 mediates immune evasion in fibrotic breast cancers via suppression of Transposable Elements [RNAseq_MCF7]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq数据(MCF7)

Pin1 mediates immune evasion in fibrotic breast cancers via suppression of Transposable Elements [RNAseq_MCF7]

该数据集来自NCBI GEO,标题为Pin1通过抑制转座子介导纤维化乳腺癌免疫逃逸的RNAseq_MCF7研究,包含1个文件(GSE294974_series_matrix.txt.gz),属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为GPL24676。数据可用于研究Pin1在纤维化乳腺癌免疫抑制中的作用、转座子激活与cGAS/STING/IFN-I通路的关系,以及基于表达谱的肿瘤免疫微环境分类分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症中的治疗耐药性常由肿瘤异质性和免疫抑制性肿瘤微环境驱动,尤其是在细胞外基质(ECM)僵硬的纤维化肿瘤中。然而,ECM硬度与免疫逃逸之间的联系机制仍知之甚少。在此,我们确定脯氨酰异构酶Pin1是纤维化乳腺癌中免疫抑制的核心介质。ECM硬化稳定Pin1并驱动其核积累,在核内它维持核膜NE和异染色质HC的完整性,从而阻止cGAS/STING/IFN-I通路的激活。抑制Pin1会破坏NE和HC结构,重新激活转座子(TEs),并通过TE衍生的新抗原诱导先天性和适应性免疫应答。在原发BC和转移灶的临床前模型中,Pin1缺失触发免疫细胞浸润,将免疫冷肿瘤转化为

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294974

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 13 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症治疗耐药常由肿瘤异质性和免疫抑制性肿瘤微环境驱动,尤其在具有僵硬细胞外基质(ECM)的纤维化肿瘤中更为突出。然而,ECM硬度与免疫逃逸之间的关联机制仍知之甚少。在此,我们鉴定出脯氨酰异构酶Pin1是纤维化乳腺癌中免疫抑制的核心介导因子。ECM硬化可稳定Pin1并驱动其核内积聚,在核内Pin1维持核膜(NE)和异染色质(HC)完整性,从而阻止cGAS/STING/IFN-I通路的激活。抑制Pin1可破坏NE和HC结构,重新激活转座元件(TEs),并通过TE衍生的新抗原诱导先天性和适应性免疫应答。在原发性乳腺癌及转移灶的临床前模型中,Pin1缺失可触发免疫细胞浸润,将免疫“冷”肿瘤转化为对免疫检查点阻断敏感的肿瘤。这些发现揭示了一种机械敏感的免疫逃逸机制,并确立Pin1作为增强纤维化癌症免疫治疗疗效的有前景的治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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