GSE290005：辐射抗性通过改变RNA代谢增强转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290005

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

介导治疗耐药的细胞程序往往是转移的重要驱动因素，这一现象需要更深入理解，以改善癌症患者的筛查和治疗选择。尽管该问题在化疗领域已被广泛研究，但关于放疗耐药与转移之间因果联系的认识仍较少。我们在三阴性乳腺癌(TNBC)中研究了这一问题，并确定放疗耐药的肿瘤细胞具有增强的转移能力，尤其是向骨的转移。放疗耐药增加整合素β3(ITGb3)的表达，从而促进迁移和侵袭能力增强。生物信息学分析及后续实验揭示，RNA代谢通路富集并稳定ITGb3转录本。具体而言，表达受Nrf2调控的RNA结合蛋白异质性核糖核蛋白L(HNRNPL)介导环状RNA(circRNAs)的形成，这些环状RNA作为竞争性内源RNA(ceRNAs)，作用于靶向ITGb3的let-7 microRNA家族。

总体而言，我们的发现揭示了一种由RNA代谢改变驱动的新型放射诱导转移机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。