GSE286448:雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌中HNRNPAB与mRNA相互作用数据集(RIP-Seq)

该数据集来自NCBI GEO,聚焦雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌中HNRNPAB蛋白与mRNA相互作用的RIP-Seq数据

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基因组预测GPL246769606
GSE286448: HNRNPAB interacted with mRNAs in estrogen receptor positive (ER+) breast cancer [RIP-Seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

GSE286448:雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌中HNRNPAB与mRNA相互作用数据集(RIP-Seq)

HNRNPAB interacted with mRNAs in estrogen receptor positive (ER+) breast cancer [RIP-Seq]

该数据集来自NCBI GEO,聚焦雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌中HNRNPAB蛋白与mRNA相互作用的RIP-Seq数据。包含1个文件(GSE286448_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序表达谱分析,涉及人类(9606)样本。可用于研究HNRNPAB在乳腺癌中的RNA结合特征及其与肿瘤进展、预后相关的分子机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):乳腺癌(BC)是全球女性中最常见的癌症类型。HNRNPAB属于异质核核糖核蛋白(hnRNPs)亚家族。近年来,研究发现HNRNPAB可参与多种人类癌症的进展。它不仅与DNA和RNA结合,还介导mRNA核运输,调控基因转录和翻译,并调控肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、衰老及其他表型。HNRNPAB与癌症患者的不良预后密切相关。此外,HNRNPAB还参与调控流感病毒的感染过程。已有简要报道指出HNRNPAB在BC中作为预后值的相关性。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE286448

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 04 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

乳腺癌(BC)是全球女性中最常见的癌症类型。HNRNPAB属于异质性核糖核蛋白(hnRNPs)亚家族。近年来,研究发现HNRNPAB可参与多种人类癌症的进展过程。它不仅能与DNA和RNA结合,还能介导mRNA的核转运、调控基因转录与翻译,并调节肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、衰老等多种表型。HNRNPAB与癌症患者的不良预后密切相关。此外,HNRNPAB还参与调控流感病毒的感染过程。目前已有简要报道指出HNRNPAB在BC中作为预后指标的相关性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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