GSE285459:ID3维持肿瘤细胞RNA稳态以强制免疫逃逸并抵抗检查点阻断

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE285459_series_matrix.txt.gz,属于肿瘤/乳腺癌分类,采用高通量测序进行表达谱分析,平台为GPL24676,物种为9606

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基因组分类GPL246769606
GSE285459: ID3 maintains RNA homeostasis in tumor cells to enforce immune evasion and resistance to checkpoint blockade

基本信息

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基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GSE285459:ID3维持肿瘤细胞RNA稳态以强制免疫逃逸并抵抗检查点阻断

ID3 maintains RNA homeostasis in tumor cells to enforce immune evasion and resistance to checkpoint blockade

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE285459_series_matrix.txt.gz,属于肿瘤/乳腺癌分类,采用高通量测序进行表达谱分析,平台为GPL24676,物种为9606。数据可用于研究ID3在肿瘤细胞中维持RNA稳态、促进免疫逃逸及抵抗免疫检查点阻断的机制,并支持相关表达谱分析与验证(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肿瘤免疫逃逸由肿瘤内在机制维持,这些机制在转录失调的情况下仍能抑制免疫原性核酸。在此,我们鉴定ID3为一种肿瘤内在因子,可维持RNA稳态并强制ICB抵抗。机制上,ID3结合并稳定SRSF3,维持前体mRNA剪接保真度并限制内源性逆转录病毒来源的内含子滞留衍生dsRNA。该相互作用依赖于ID3 HLH结构域内的Asp75/Asp79和SRSF3富含精氨酸RS结构域内的残基121-130,尽管经典E蛋白通路可能对RNA稳态有贡献。ID3的遗传缺失或药理学抑制触发dsRNA感知和IFN-I反应,增强MHC-I表达和CD8⁺ T细胞浸润,并在乳腺癌和黑色素瘤模型中克服抗PD-1耐药。人类肿瘤标本中低ID3表达与

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285459

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 12 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤免疫逃逸由肿瘤内在机制维持,这些机制尽管存在转录失调,仍能抑制免疫原性核酸。在此,我们将ID3鉴定为一种肿瘤内在因子,可维持RNA稳态并强制实现ICB耐药。机制上,ID3结合并稳定SRSF3,维持前体mRNA剪接保真度,并限制源自内源性逆转录病毒的内含子保留衍生dsRNA。这种相互作用依赖于ID3 HLH结构域内的Asp75/Asp79以及SRSF3富含精氨酸RS结构域内的第121-130位残基,尽管经典E蛋白通路可能对RNA稳态有贡献。ID3的基因缺失或药理学抑制可触发dsRNA感知和IFN-I反应,增强MHC-I表达和CD8⁺ T细胞浸润,并克服乳腺癌和黑色素瘤模型中的抗PD-1耐药。人类肿瘤标本中ID3低表达与CD8⁺ T细胞浸润升高、生存改善以及更优的ICB反应相关。总之,我们的研究结果确立了ID3-SRSF3通路作为连接RNA稳态与肿瘤免疫逃逸及免疫治疗的治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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