新辅助HER2抑制诱导ESR1 DNA甲基化改变导致乳腺癌ER表达临床相关变化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE283272

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数据说明

乳腺癌疾病进展过程中雌激素受体（ER）和HER2状态的分歧对临床管理和长期生存具有重要影响。分子亚型表达是动态的，并受治疗干预和转移微环境的影响。在治疗前活检、残留病灶患者的治疗后样本以及相关情况下的转移性肿瘤样本中评估了HER2状态、ER表达水平和全局DNA甲基化。甲基化图谱的绘制显示，治疗后整体呈现低甲基化增益（n=7对匹配肿瘤，16份样本），而转移灶则呈现高甲基化（n=5对匹配肿瘤，14份样本）。关键信号通路（包括雌激素反应、上皮-间质转化和PI3K/AKT/mTOR）的差异甲基化在治疗后和转移灶之间是保守的。然而，当核心通路基因在治疗后呈低甲基化时，在转移灶中则转变为高甲基化，从而促进肿瘤表型的改变。

本研究揭示了DNA甲基化是乳腺癌进展中的关键过程，为靶向HER2治疗的效果提供了重要见解。这项工作为开发HER2抑制剂与内分泌治疗联合策略以改善HER2阳性患者的长期生存提供了明确依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。