PML-mTOR-RONIN核复合物调控三阴性乳腺癌核糖体基因表达与衰老的ChIP-seq_mTOR数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE283108

标准获取流程：

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数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）是乳腺癌中最具侵袭性的形式，与预后不良和高复发风险相关，且治疗选择有限。虽然衰老（一种细胞生长停滞状态）的诱导通常可通过现有的抗癌治疗实现，但衰老可通过一种被称为衰老相关分泌表型（SASP）的持续增强的炎症状态而不利地促进肿瘤发生。因此，迫切需要精确阐明调控衰老的潜在调控机制。在此，我们研究了在TNBC中沉默早幼粒细胞白血病蛋白（PML）表达所引发的有益抗癌衰老反应，其中PML发挥致癌作用。功能基因组学研究揭示了一组与不良临床结局相关的特定核糖体蛋白（RP）基因的下调。单独重新引入RPL38或RPL39L（而非RPS14，一种与良好结局相关的RP）足以阻断PML敲低所诱导的衰老表型。

研究发现，PML对RP基因的调控涉及在它们的启动子上组装一个此前未被认识的PML-mTOR-RONIN转录复合体。此外，我们显示RONIN水平在TNBC中升高，并且RONIN沉默能够重现PML缺陷细胞的衰老表型。这项工作为TNBC提供了新的治疗见解，涉及诱导衰老的疗法或衰老细胞清除药物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。