原发乳腺癌肿瘤冷冻消融诱导系统性远隔效应改变远处肿瘤TIME(肿瘤免疫微环境)
该数据集来自NCBI GEO,聚焦三阴性乳腺癌(TNBC)原发肿瘤冷冻消融后对远处肿瘤免疫微环境(TIME)的系统性远隔效应

基本信息
资源简介
原发乳腺癌肿瘤冷冻消融诱导系统性远隔效应改变远处肿瘤TIME(肿瘤免疫微环境)
Cryoablation of primary breast cancer tumors induces a systemic abscopal effect altering TIME (Tumor-Immune Micro-Environment) in distant tumors.
该数据集来自NCBI GEO,聚焦三阴性乳腺癌(TNBC)原发肿瘤冷冻消融后对远处肿瘤免疫微环境(TIME)的系统性远隔效应。数据基于双侧肿瘤小鼠模型,采用高通量测序进行表达谱分析,包含1个series matrix文件。可用于研究冷冻消融对比手术切除在诱导抗肿瘤免疫应答、T细胞活化及远处肿瘤免疫浸润方面的差异,为TNBC创新治疗策略提供转录组层面的数据支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管近期取得进展,三阴性乳腺癌(TNBC)患者仍面临高复发和转移风险,这需要创新性治疗方法来改善患者预后。冷冻消融是一种有前景、侵入性较小的手术切除替代方案,能够通过冻融循环诱导肿瘤坏死。坏死性细胞死亡导致炎症信号增加和保留的肿瘤抗原释放,这些有可能增强局部和系统性抗肿瘤免疫应答。因此,与手术相比,冷冻消融增强T细胞活化,从而改善远隔效应,远隔效应定义为局部治疗后发生系统性应答。我们此前利用TNBC双侧肿瘤小鼠模型表明,原发肿瘤冷冻消融导致远处肿瘤中肿瘤浸润淋[巴细胞]浸润增加。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE282249
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 30 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
尽管近年来取得了进展,三阴性乳腺癌(TNBC)患者仍面临较高的复发和转移风险,因此需要创新的治疗方法来改善患者预后。冷冻消融是一种有前景的、创伤较小的手术切除替代方案,能够通过冻融循环诱导肿瘤坏死。坏死性细胞死亡导致炎症信号增加并释放保留的肿瘤抗原,这些抗原具有增强局部和全身抗肿瘤免疫反应的潜力。因此,与手术相比,冷冻消融增强了T细胞的活化,从而改善了远隔效应,即局部治疗后发生全身性反应。我们此前利用TNBC双侧肿瘤小鼠模型表明,原发肿瘤的冷冻消融导致肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)对远处肿瘤的浸润增加,并降低了复发率和转移率。
然而,冷冻消融所产生的远隔效应(abscopal effect)的早期驱动因素仍不清楚,了解其机制可为在冷冻消融之外通过药物免疫调节来改善抗肿瘤免疫应答提供思路。在本研究中,我们表明,与手术切除相比,小鼠乳腺癌的冷冻消融可导致远端肿瘤缩小,且其中抗肿瘤细胞(如自然杀伤(NK)细胞)的频率增加,同时伴有迁移性经典1型树突状细胞(cDC1;CD103+ XCR1+)频率的系统性增加。细胞频率的变化与远端肿瘤的免疫基因特征相一致,冷冻消融诱导了与NK细胞活化和白细胞介导的毒性相关的基因,包括IL11ra1和Pfr1。这些结果更好地阐明了冷冻消融改善肿瘤清除的早期机制,该机制由远端肿瘤及……中抗肿瘤细胞(如NK细胞和cDC1)频率的增加所介导。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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