卡铂处理人乳腺癌细胞转录组分析数据集
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE278231,收录人乳腺癌细胞经卡铂处理后的转录组高通量测序表达谱数据,共 1 个文件(GSE278231_series_matrix.txt.gz)

基本信息
资源简介
卡铂处理人乳腺癌细胞转录组分析数据集
Transcriptomic analysis of human breast cancer cells upon carboplatin treatment
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE278231,收录人乳腺癌细胞经卡铂处理后的转录组高通量测序表达谱数据,共 1 个文件(GSE278231_series_matrix.txt.gz)。源站描述指出,铂类药物以核 DNA 为主要靶点,化疗过程中活性氧(ROS)稳态水平升高并诱导氧化应激反应,进而调控细胞存活与耐药;研究以卡铂为例系统分析癌细胞对 ROS 的动态响应。该数据可用于研究卡铂诱导 ROS 的生成途径、氧化应激相关基因表达变化及药物反应机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):铂类药物具有广谱和高抗癌活性,以核 DNA 为主要靶点。在铂类化疗过程中,活性氧(ROS)的稳态水平通常升高并诱导氧化应激反应,从而调控细胞存活和耐药。目前,一种新的核-线粒体 ROS 通路已被鉴定。然而,铂类药物生成 ROS 的途径以及生物学响应仍缺乏系统研究。以卡铂为例,我们系统分析了癌细胞对 ROS 的动态响应。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278231
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 31 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
铂类药物具有广谱、高抗癌活性,以核DNA为主要靶点。在铂类化疗过程中,活性氧(ROS)的稳态水平通常升高并诱导氧化应激反应,从而调控细胞存活与耐药性。目前,一种新的从细胞核到线粒体的ROS通路已被鉴定。然而,铂类药物生成ROS的途径及其生物学响应仍缺乏系统研究。以卡铂为例,我们系统分析了癌细胞对ROS的动态响应。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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