工程化人骨髓转移定植模型揭示乳腺癌细胞重塑造血微环境

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277786

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对转移性疾病机制的认识不完整，继续阻碍着癌症的有效治疗。尽管在识别可成药靶点方面取得了显著进展，但原发性肿瘤切除后处于缓解期患者的治疗选择仍然有限。能够重现转移定植生理相关微环境的转移部位生物工程化人体组织模型，或可加深我们对癌症进展的理解，并有助于开发有效的治疗策略。我们报告了使用人骨髓工程化组织模型（eBM）来识别调控癌细胞增殖的微环境线索，并研究三阴性乳腺癌细胞系如何影响造血。值得注意的是，骨髓微环境的各个基质成分（成骨细胞、内皮细胞和间充质干细胞/基质细胞）对于三维eBM微环境中肿瘤细胞静息和增殖的调控均至关重要。在本数据集中，我们提供了MDA-MB-231癌细胞经不同eBM组织变体共培养预处理后的bulk RNA测序转录组信息。

我们设想，这种人体组织模型将促进对特定微环境转移进展及个体化治疗反应的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。