复合物I抑制联合TLR激活在乳腺肿瘤微环境中诱导细胞毒性中性粒细胞 [scRNA-seq]
研究探讨在乳腺肿瘤微环境中,TLR激活联合复合物I抑制如何直接或间接作用于中性粒细胞,使其获得直接杀伤肿瘤的能力,且不依赖CD8+ T细胞免疫
![GSE272922: Complex I Inhibition combined with TLR Activation in the Breast Tumor Microenvironment Educates Cytotoxic Neutrophils [scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/218590.jpg)
基本信息
资源简介
复合物I抑制联合TLR激活在乳腺肿瘤微环境中诱导细胞毒性中性粒细胞 [scRNA-seq]
Complex I Inhibition combined with TLR Activation in the Breast Tumor Microenvironment Educates Cytotoxic Neutrophils [scRNA-seq]
该数据集为小鼠乳腺癌单细胞RNA测序数据,来源于NCBI GEO(GSE272922),包含1个文件(GSE272922_series_matrix.txt.gz)。研究探讨在乳腺肿瘤微环境中,TLR激活联合复合物I抑制如何直接或间接作用于中性粒细胞,使其获得直接杀伤肿瘤的能力,且不依赖CD8+ T细胞免疫。数据可用于分析中性粒细胞在肿瘤微环境中的转录状态、免疫调节功能及相关基因表达特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 23 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):中性粒细胞已成为组织状态多样化的调节者,在组织炎症的消退和促进中均表现出功能。虽然中性粒细胞广泛与肿瘤促进、免疫抑制和患者预后不良相关,但我们提供了证据支持中性粒细胞具有直接的肿瘤细胞毒性特性。利用多种小鼠乳腺癌模型,我们证实,在乳腺肿瘤微环境中,TLR介导的参与联合复合物I抑制,无论直接或间接作用于中性粒细胞,都能在体外和体内启动这些先天免疫细胞获得直接杀伤肿瘤的特性,且不依赖于CD8+ T细胞免疫。TLR参与刺激紧急粒细胞生成,增加循环中的中性粒细胞水平并浸润到肿瘤中,而不诱导形成促转移生态位。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272922
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 29 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
中性粒细胞已成为组织状态多样化的调节者,在组织炎症的消退和促进中均发挥功能。尽管中性粒细胞广泛与肿瘤促进、免疫抑制及患者不良预后相关,我们提供了支持中性粒细胞具有直接肿瘤细胞毒性特性的证据。利用多种小鼠乳腺癌模型,我们证实,在乳腺肿瘤微环境中,TLR介导的参与结合复合物I抑制,直接或间接作用于中性粒细胞,使这些先天免疫细胞在体外和体内获得直接杀伤肿瘤的特性,且不依赖于CD8+ T细胞免疫。TLR参与刺激紧急粒细胞生成,增加循环中中性粒细胞水平并使其浸润至肿瘤中,而不诱导促转移龛的形成。在机制上,我们显示全身给予多种TLR激动剂在增加全身炎症的同时,升高中性粒细胞中的NFkB信号传导,从而促进其杀肿瘤功能。
此外,利用bulk和单细胞RNA测序以及蛋白质组学方法发现,被训练获得这些抗肿瘤功能的中性粒细胞,其分泌颗粒生成增强,NADPH氧化酶机制的表达增加。与此同时,这些具有杀肿瘤作用的中性粒细胞产生毒性水平的活性氧,而这一效应可通过髓过氧化物酶抑制剂或过表达ROS清除剂来克服。综上所述,我们描述了一类新型中性粒细胞,其具有直接且内在的杀肿瘤功能,可用于根除免疫"冷"乳腺癌——此类肿瘤对标准免疫治疗(包括免疫检查点阻断)原本无效。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




