复合物I抑制联合TLR激活在乳腺肿瘤微环境中诱导细胞毒性中性粒细胞 [bulk RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272921

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数据说明

中性粒细胞已成为组织状态多样化的调节者，在组织炎症的消退和促进中均发挥功能。尽管中性粒细胞广泛与肿瘤促进、免疫抑制及患者不良预后相关，我们提供了支持中性粒细胞具有直接肿瘤细胞毒性特性的证据。利用多种小鼠乳腺癌模型，我们证实，在乳腺肿瘤微环境中，TLR介导的参与结合复合物I抑制，直接或间接作用于中性粒细胞，使这些先天免疫细胞在体外和体内获得直接杀伤肿瘤的特性，且不依赖于CD8+ T细胞免疫。TLR参与刺激紧急粒细胞生成，增加循环中中性粒细胞水平并使其浸润至肿瘤中，而不诱导促转移龛的形成。在机制上，我们显示全身给予多种TLR激动剂在增加全身炎症的同时，升高中性粒细胞中的NFkB信号传导，从而促进其杀肿瘤功能。

此外，利用bulk和单细胞RNA测序以及蛋白质组学方法发现，被训练获得这些抗肿瘤功能的中性粒细胞，其分泌颗粒生成增强，NADPH氧化酶机制的表达增加。与此同时，这些具有杀肿瘤作用的中性粒细胞产生毒性水平的活性氧，而这一效应可通过髓过氧化物酶抑制剂或过表达ROS清除剂来克服。综上所述，我们描述了一类新型中性粒细胞，其具有直接且内在的杀肿瘤功能，可用于根除免疫"冷"乳腺癌——此类肿瘤对标准免疫治疗（包括免疫检查点阻断）原本无效。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。