十一种数据匮乏型双酚A替代品的高通量转录组学毒性评估

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271332

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数据说明

双酚A（BPA）是一种广泛用于塑料和环氧树脂生产的化学物质，因其与不良健康效应相关，尤其是其内分泌干扰特性，而受到广泛关注。旨在减少人类BPA暴露的监管措施导致了各种消费品中替代化学物质的激增。尽管这些替代品有助于减少BPA暴露，但人们对其安全性和潜在毒性产生了担忧，认为它们可能成为令人遗憾的替代物。此前的研究已表明，体外高通量转录组学（HTTr）研究可用于评估BPA替代品的内分泌干扰潜力，并且与传统的啮齿动物研究得出的POD相比，该策略产生的转录组学起点（tPoDs）对人类健康具有保护性。在本研究中，我们利用体外HTTr的进展来评估十一种与BPA结构相似、数据匮乏的遗留化学物质的毒性。将人乳腺癌MCF-7细胞暴露于BPA及11种替代品，浓度范围为（0.1 - 25 µM），以评估毒性。

对全球转录组变化的分析以及先前表征的雌激素受体α（ERα）生物标志物特征显示，11种化学物质中有9种具有生物活性。其中一种化学物质（2,4’-双酚A）在与BPA（即4,4’-BPA）相同的浓度下激活了ERα生物标志物，但因其在更低浓度下即可诱导全球转录组变化而被认为效力更强。这些结果正在填补正在进行的筛选评估中的数据空白，以识别具有危害潜力的BPA替代品，并有助于确定可作为更安全替代品的潜在候选物质。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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