rigosertib 耐药 MDA-MB-453 细胞转录组分析（WNK1 敲除 CRISPR 筛选）
源站描述指出 WNK1 激酶作为渗透应激主调控因子，其失活改变微管稳定性与聚合动力学，导致对微管解聚药物耐药、对微管稳定药物敏感性增加
基本信息
资源简介
rigosertib 耐药 MDA-MB-453 细胞转录组分析（WNK1 敲除 CRISPR 筛选）
Transcriptome analysis of rigosertib resistant MDA-MB-453 cells, obtained from a CRISPR screen with WNK1 depletion.
该数据集来自 NCBI GEO（GSE271314），对经全基因组 CRISPR-Cas9 耐药药物筛选、WNK1 敲除后获得的 rigosertib 耐药 MDA-MB-453 乳腺癌细胞进行转录组分析，仅含 1 个文件 GSE271314_series_matrix.txt.gz。源站描述指出 WNK1 激酶作为渗透应激主调控因子，其失活改变微管稳定性与聚合动力学，导致对微管解聚药物耐药、对微管稳定药物敏感性增加。数据可用于研究 WNK1 渗透调节作为微管相关化疗反应生物标志物的潜力（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 02 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：在全基因组 CRISPR-Cas9 耐药药物筛选中，我们鉴定出渗透应激主调控因子 WNK1 激酶是丝分裂药物 rigosertib 反应的调节因子。渗透应激和 WNK1 失活不仅导致对 rigosertib 的反应改变，也导致对其他微管相关药物的反应改变，使这些药物产生的典型丝分裂阻滞最小化。这一效应源于微管稳定性和聚合动力学的改变，可能由 WNK1 失活时细胞内分子拥挤的波动所维持。这促进了对微管解聚药物的耐药性，并增加了对微管稳定药物的敏感性。总之，我们的数据提出 WNK1 渗透调节活性可作为微管相关化疗反应的生物标志物。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL21697、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271314
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 10 202，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271314
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
在全基因组CRISPR-Cas9耐药性药物筛选实验中，我们发现主渗透应激调节因子WNK1激酶是有丝分裂药物rigosertib应答的调节因子。渗透应激和WNK1失活不仅导致对rigosertib的应答改变，也改变了对其他微管相关药物的应答，使这些药物典型的有丝分裂阻滞降至最低。这一效应源于微管稳定性和聚合动力学的改变，可能由WNK1失活时细胞内分子拥挤度的波动所维持。这促进了对微管解聚药物的耐药性，并增加了对微管稳定药物的敏感性。总之，我们的数据提出WNK1渗透调节活性可作为微管相关化疗应答的生物标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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