GDNF处理与抗NCAM1处理EO771-tdT-LM2细胞在缺糖培养基下的转录组表达差异

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263233

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

调节乳腺癌细胞（BCC）在软脑膜（LM）内转移和增殖的分子机制尚不清楚，这限制了有效疗法的开发。在此，我们展示小鼠体内的BCC可通过沿连接椎骨/颅骨骨髓与脑膜的血管进行腔外迁移而侵入LM，从而绕过血脑屏障。这一过程依赖于BCC通过表达神经元导向分子整合素α6与血管基底膜层粘连蛋白的结合。一旦进入LM，BCC便与血管周围脑膜巨噬细胞共定位，并诱导其表达促生存神经营养因子GDNF。鞘内阻断GDNF、巨噬细胞特异性消融GDNF，或从BCC中敲除GDNF受体NCAM，均可抑制LM内BC的生长。在此，我们对在葡萄糖剥夺培养基处理下经GDNF处理和/或抗NCAM1处理的EO771-tdT-LM2细胞进行了RNA-seq分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。