GSE244537：HER2阳性乳腺癌曲妥珠单抗进化适应中表观遗传修饰与染色质结构改变导致脂质代谢重编程的揭示

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244537

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数据说明

继发性曲妥珠单抗耐药代表HER2阳性乳腺癌在抗HER2治疗过程中的进化适应。目前大多数研究倾向于优先关注HER2及其相关信号通路，往往忽视更广泛但似乎不太相关的细胞过程及其相关的遗传和表观遗传机制。本研究不仅对转录组数据进行了表征，还考察了曲妥珠单抗敏感和继发性耐药乳腺癌细胞的表观基因组和三维基因组结构信息。研究结果揭示，与曲妥珠单抗耐药相关的全局代谢重编程可能源于组蛋白修饰和染色质结构的全基因组改变。具体而言，参与脂质代谢的关键基因的转录活性似乎受到变异型启动子H3K27me3和H3K4me3修饰以及启动子-增强子相互作用的调控。这些发现为癌细胞如何适应抗肿瘤药物提供了有价值的见解，并有可能影响未来的诊断和治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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