正常人乳腺稳态成纤维细胞亚型作为乳腺癌扰动状态成纤维细胞起源的证据

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数据说明

摘要 背景：人乳腺癌最常起源于一个明确界定的解剖结构，称为终末导管小叶单位（TDLU）。该结构具有其自身的小叶成纤维细胞，代表两种稳态成纤维细胞亚型之一——另一种是小叶间成纤维细胞。虽然癌症相关成纤维细胞（CAFs）日益被认为涵盖了一系列扰动状态，但我们对其与稳态成纤维细胞亚型之间的关系——如果存在的话——缺乏一致的理解。为解决这一问题，我们在此建立了两个自体CAF细胞系，分别代表炎症性CAFs（iCAFs）和肌成纤维细胞CAFs（myCAFs），并将它们与已建立的小叶间和小叶成纤维细胞在起源和对肿瘤形成的影响方面进行了比较。方法：将原发乳腺肿瘤来源的CAFs转导以表达人端粒酶逆转录酶（hTERT），并使用荧光激活细胞分选（FACS）分选为CD105低和CD105高群体。

通过全转录组RNA测序（RNA-Seq）对这两个细胞群体进行了与iCAF和myCAF状态的差异性相似性检测，包括与现有的iCAF-myCAF细胞状态图谱进行比较。小叶间和小叶成纤维细胞的起源推断依赖于RNA-seq表达谱、免疫细胞化学和生长特征。在培养和体内采用成骨分化和骨形成实验来评估骨髓间充质干细胞（bMSCs）的起源。功能特征评估包括培养中的收缩性以及与小鼠异种移植中肿瘤细胞的相互作用。使用癌症基因组图谱数据库（TCGA）中的生存数据，检验了这些细胞的基因表达特征与乳腺癌患者临床结局的关联。结果：我们证明iCAFs具有与小叶间成纤维细胞共同的特性，而myCAFs和小叶成纤维细胞则r

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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