骨桥蛋白连接乳腺癌抗血管生成获得性耐药与抗PD-L1难治性

该数据集为GSE241539,来源于ncbi.nlm.nih.gov,主题为骨桥蛋白将缺氧诱导性抗血管生成药物的获得性耐药与抗PD-L1药物难治性联系起来

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GSE241539: Osteopontin links acquired resistance to hypoxia-inducing antiangiogenics with refractoriness to anti-PD-L1 agents in breast cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

骨桥蛋白连接乳腺癌抗血管生成获得性耐药与抗PD-L1难治性

GSE241539 是一个来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)的肿瘤学相关数据集,聚焦于乳腺癌研究。其英文标题为“Osteopontin links acquired resistance to hypoxia-inducing antiangiogenics with refractoriness to anti-PD-L1 agents in breast cancer”,中文可理解为探讨骨桥蛋白如何将缺氧诱导性抗血管生成药物的获得性耐药与抗 PD-L1 药物难治性联系起来。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,并关联 GPL21626 平台与 10090 物种编号。数据集由 José L. Ruiz-Sepúlveda 提交,发布时间为 Aug 23 202(源站所载年份信息不完整)。整体来看,该数据集围绕乳腺癌治疗耐药机制,尤其是抗血管生成治疗与免疫治疗交叉耐药的分子线索展开,适合关注肿瘤微环境、缺氧、免疫逃逸及联合治疗策略的研究者参考。

【数据集背景】

该数据集的研究背景集中于乳腺癌治疗中的耐药问题。标题明确指出,骨桥蛋白(Osteopontin)在缺氧诱导性抗血管生成药物的获得性耐药与抗 PD-L1 药物难治性之间建立了联系。这意味着该研究试图解释:当肿瘤对抑制血管生成的药物产生获得性耐药后,为何也会对抗 PD-L1 免疫治疗表现出难治性,以及骨桥蛋白在这一过程中可能扮演的桥梁角色。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供更详细的研究背景、实验设计或样本分组信息。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE241539_series_matrix.txt.gz。从文件命名来看,这是一个系列矩阵文件,通常用于汇总表达谱数据。主题标签中包含“Expression profiling by high throughput sequencing”,表明数据属于高通量测序表达谱分析。此外,标签中还出现 GPL21626 与 10090,分别指向特定的检测平台与物种编号。源站未提供具体的样本数量、基因数量、分组信息、表达矩阵维度或任何统计结果。文件以 GZIP 压缩包形式提供,内部应为文本格式的矩阵数据。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 的 GEO 数据库体系。源站标题与数据集英文名一致,均为“Osteopontin links acquired resistance to hypoxia-inducing antiangiogenics with refractoriness to anti-PD-L1 agents in breast cancer”。作者为 José L. Ruiz-Sepúlveda,发布时间为 Aug 23 202。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供具体的采集方法、实验条件、样本处理流程或测序细节。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌耐药机制研究,尤其是涉及抗血管生成药物获得性耐药与抗 PD-L1 免疫治疗难治性之间关联的分析。主题标签中的高通量测序表达谱提示,该数据可用于差异表达分析、通路富集分析或候选基因筛选。由于标题提及骨桥蛋白,研究者可能关注其在缺氧、血管生成和免疫检查点调控中的潜在作用。此外,该数据也可用于方法学验证,例如在小样本上核对字段与编码后,再批量接入分析流程。源站未提供具体的适用分析类型或推荐工具。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE241539_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取时需按相应格式解压。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于文件为系列矩阵格式,通常包含样本信息与表达值,适合用常规表达谱分析工具处理。源站未提供具体的代码示例、软件推荐或参数设置。

【质量与限制】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE241539_series_matrix.txt.gz。源站描述仅说明其为 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,未提供质量控制指标、重复数、批次信息或标准化方法。发布时间为 Aug 23 202,年份信息不完整。主题标签中的 GPL21626 与 10090 提供了平台与物种线索,但源站未提供样本量、测序深度、覆盖度或任何验证实验结果。因此,在使用时需自行评估数据质量与适用性。

【引用与许可】

该数据集的作者为 José L. Ruiz-Sepúlveda,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用限制。如需引用或使用,建议直接访问源站页面获取最新信息。源站未提供 DOI、期刊信息或数据共享声明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241539

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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