基于SMART-Seq2技术的4T1与4T1.2细胞骨转移不同阶段基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241165

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

骨转移是乳腺癌中常见且极具破坏性的现象，随着时间推移，超过70%的患者会受到影响。有趣的是，驻留在骨微环境中的癌细胞可作为“癌症种子”，播散至远处器官并驱动广泛的转移。即使在原发肿瘤成功切除后，静息细胞仍可持续存在，导致骨复发。这一现象凸显了骨转移建立效率极低的特点，也强调了理解这一早期骨播种阶段分子基础的重要性。阐明调控肿瘤细胞休眠与再觉醒的机制，对于设计有效的抗癌疗法具有关键意义。骨内的休眠肿瘤细胞或可被比作在最终扩增之前被困于“延长的播种阶段”。可以设想，共享的信号分子可能同时调控高效的骨转移定植与惰性转移细胞的再出现。因此，促成骨定植的分子促进因素也可能在骨微环境中休眠肿瘤细胞的再激活过程中发挥不可或缺的作用。

在本研究中，我们对实验性骨转移模型早期骨定植阶段获取的肿瘤细胞进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析。我们的研究揭示了在这一关键播散阶段促进肿瘤细胞存活的潜在因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。