乳腺癌及健康女性血浆miRNA表达数据（含代谢综合征相关改变）[测序]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235354

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

乳腺癌（BCa）是全球女性癌症死亡的主要原因。早期诊断正在提高BCa患者的生存率，但仍需要更敏感和特异的工具。我们提出使用miRNA作为BCa诊断的替代生物标志物。miRNA是调节基因表达的小型非编码RNA。循环miRNA可在体液中检测到。组织和体液中miRNA的异常表达与多种病理相关。此外，代谢综合征（MeS）是BCa的危险因素。这种关联背后的分子机制尚未完全阐明。本工作的目的是鉴定伴有或不伴有与MeS相关的临床特征的BCa患者和健康供者血浆中的循环miRNA。从女性血浆中分离miRNA。BCa患者（N=30）根据其BCa分期分为5个集群：i）0期和IA期，ii）IIA期，iii）IIB期，iv）IIIA期，以及v）IIIB期、IIIC期和IV期。

健康女性（HD）（N=36）被招募并分为两组：对照组或MeS相关疾病组（MeSL），后者需满足以下条件中的两项或以上：BMI≥25.00 kg/m²、腰围≥82 cm或高血压（收缩压≥120，舒张压≥80）。我们使用GeneChip® miRNA 4.0 Array（Affymetrix）对每组的miRNA进行杂交分析。同时，还通过miRNA测序对6例BC患者和4例HD的miRNA表达谱进行了测定。数据分析显示，与HD相比，BCa患者血浆中有11个miRNA表达上调。与此同时，与对照组相比，MeSL女性血浆中有24个miRNA发生改变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。