肿瘤细胞通过中枢神经系统富集代谢物损害免疫突触形成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE233484

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤采用多种策略逃避免疫监视。中枢神经系统（CNS）具有多种抑制免疫反应的特征，因为颅内炎症可迅速发展为致命的脑水肿。然而，肿瘤与CNS是否共享相似的免疫耐受程序尚不清楚。在此，我们分析了接受曲妥珠单抗、抗PD-L1抗体和多西他赛治疗的HER2+乳腺癌患者肿瘤的转录组和代谢组图谱（KN035-TH-HER2研究）。我们发现，一种神经元代谢物N-乙酰天冬氨酸（NAA）及其合成酶N-乙酰转移酶8样蛋白（NAT8L）在耐药肿瘤中富集。在CNS中，NAA在脑炎症期间被释放。我们证明，NAT8L在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中减轻脑炎症，并通过NAA抑制NK细胞和CD8+ T细胞的细胞毒性而损害抗肿瘤免疫。在机制上，NAA通过诱导核纤层蛋白A的K542乙酰化而破坏免疫突触的形成，从而抑制核纤层蛋白A与SUN2之间的整合，进而损害NK细胞和CD8+ T细胞中裂解颗粒的极化。

我们的研究揭示，肿瘤细胞模拟中枢神经系统的抗炎保护屏障以逃避免疫系统的抗肿瘤作用，而NAT8L是提高抗癌药物疗效的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。