Periostin+基质细胞引导癌细胞淋巴血管侵袭 [DSP]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231806

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌细胞向哨兵淋巴结的播散与患者不良预后相关，尤其在乳腺癌中更为显著。癌细胞在与淋巴血管系统接触后从原发肿瘤逸出的过程十分复杂，由癌细胞与基质细胞（包括癌相关成纤维细胞，CAFs）之间的动态相互作用所驱动。基质细胞蛋白骨膜蛋白可区分乳腺癌中的CAF亚型，并与患者促结缔组织增生增加及疾病复发相关。然而，由于骨膜蛋白是分泌型蛋白，表达骨膜蛋白的CAFs难以在原位进行表征，这限制了我们对它们促进癌症进展的具体贡献的理解。在此，我们采用体内遗传标记和消融技术对骨膜蛋白阳性细胞进行谱系追踪，并表征其在肿瘤生长和转移过程中的功能。表达骨膜蛋白的CAFs在空间上分布于导管周围和血管周围边缘，富集于淋巴管外周，并且被高转移性癌细胞相对于低转移性癌细胞差异性激活。

令人惊讶的是，基因层面耗竭骨膜蛋白阳性（periostin+）癌相关成纤维细胞（CAFs）轻微加速了原发肿瘤生长，但损害了肿瘤内胶原组织化，并抑制了淋巴转移，而非肺转移。在CAFs中消融骨膜蛋白削弱了它们沉积排列胶原基质的能力，并抑制了癌细胞通过胶原及穿越淋巴管内皮细胞单层的侵袭。因此，高转移性癌细胞在原发肿瘤部位动员表达骨膜蛋白的CAFs，促进胶原重塑和细胞集体侵袭进入淋巴管，最终到达前哨淋巴结。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。