MCF7衍生多器官转移的单细胞分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE230612

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

骨转移可播散至继发部位并促进乳腺癌进展，从而带来额外的临床挑战。促成继发性转移的机制尚不清楚。本研究分析了137例初始为HR+/Her2-状态的转移性乳腺癌（MBC）患者队列中的13,000余个循环肿瘤细胞（CTCs），评估Her2+ CTCs的预测能力，并采用骨转移（BM）的临床前模型验证Her2+ CTCs在多器官转移中的作用。虽然骨转移患者的Her2+表达较高，但实验分析显示，这些源自骨病灶的Her2+ CTCs大多数更依赖Her2活性，且对抗Her2治疗更敏感。靶向骨介导的Her2诱导可减少CTC检出并阻断来自骨的继发性转移。总体而言，我们阐明Her2+ CTCs可作为BM形成的非侵入性生物标志物，对HR+ MBC患者具有较高的治疗获益。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。