细胞间HIF1alpha重编程乳腺祖细胞与髓系免疫逃逸驱动高危乳腺病变
研究聚焦缺氧条件下乳腺癌细胞释放的小细胞外囊泡(sEV)如何破坏正常乳腺上皮分化层级、扩增干/腔祖细胞并诱导非典型导管增生,同时伴随S100A9升高的髓系免疫抑制及EMT、血管生成和腔细胞侵袭等致癌特征;在MMTV-PyMT驱动癌基因背景下,缺氧sEV加速双侧乳腺癌发生与进展

基本信息
资源简介
细胞间HIF1alpha重编程乳腺祖细胞与髓系免疫逃逸驱动高危乳腺病变
INTERCELLULAR HIF1alpha REPROGAMS MAMMARY PROGENITORS AND MYELOID IMMUNE EVASION TO DRIVE HIGH-RISK BREAST LESIONS
该数据集来自NCBI GEO(GSE225986),包含1个文件(GSE225986_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序的表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为GPL19057。研究聚焦缺氧条件下乳腺癌细胞释放的小细胞外囊泡(sEV)如何破坏正常乳腺上皮分化层级、扩增干/腔祖细胞并诱导非典型导管增生,同时伴随S100A9升高的髓系免疫抑制及EMT、血管生成和腔细胞侵袭等致癌特征;在MMTV-PyMT驱动癌基因背景下,缺氧sEV加速双侧乳腺癌发生与进展。数据可用于探索HIF1alpha相关细胞间通讯与高危乳腺病变的分子机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 23 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):乳腺癌的起源,无论是原发性还是复发性,尚不清楚。在此,我们展示在缺氧条件下,侵袭性乳腺癌细胞释放小细胞外囊泡(sEV),破坏正常乳腺上皮的分化层级,扩增干细胞和腔祖细胞,并诱导非典型导管增生、细胞增殖和上皮内瘤变。在体内,这伴随全身性免疫抑制,髓系细胞释放的“警报素”S100A9增加,以及EMT、持续血管生成和局部及播散性腔细胞侵袭等多种致癌特征。当应用于驱动癌基因(MMTV-PyMT)的遗传背景时,缺氧sEV加速双侧乳腺癌的发生和进展。在机制上,对缺氧sEV中包装的缺氧诱导因子-1α(HIF1α)进行遗传或药理学靶向,或同
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE225986
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 12 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
乳腺癌的起源,无论是原发性还是复发性,目前尚不清楚。在此,我们展示在缺氧条件下,侵袭性乳腺癌细胞释放的小细胞外囊泡(sEV)会破坏正常乳腺上皮的分化层级,扩增干细胞和管腔祖细胞,并诱导非典型导管增生、细胞增殖及上皮内瘤变。这一过程伴随着全身性免疫抑制,表现为髓系细胞释放“警报素”S100A9增多,以及体内EMT的多项致癌特征、持续血管生成及局部和播散性管腔细胞侵袭。当应用于驱动 oncogene(MMTV-PyMT)的遗传背景时,缺氧sEV加速了双侧乳腺癌的发生和进展。机制上,针对缺氧sEV中包裹的缺氧诱导因子-1α (HIF1α) 的基因或药物靶向,或S100A9的纯合缺失,可使乳腺分化正常化,恢复T细胞功能,并防止非典型增生。
sEV诱导的乳腺病变转录组与管腔型乳腺癌相似,且管腔型乳腺癌患者血浆循环sEV中HIF1的检测与临床复发相关。因此,多效性sEV-HIF1信号轴驱动乳腺局部及全身转化机制,使乳腺处于高风险发展为完全性、多灶性乳腺癌。该通路或可提供一种易于获取的管腔型乳腺癌进展生物标志物。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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