乳腺癌原发肿瘤疾病进展动态表观转录组图谱RNA测序数据集
该数据集来自 NCBI GEO（GSE214789），对 14 例原发性乳腺肿瘤样本进行 RNA-seq 比较分析，其中 7 例对治疗应答良好、7 例在内分泌治疗中出现疾病复发
基本信息
资源简介
乳腺癌原发肿瘤疾病进展动态表观转录组图谱RNA测序数据集
RNA-sequencing for dynamic epi-transcriptomic landscape mapping with disease progression in patient primary breast tumours.
该数据集来自 NCBI GEO（GSE214789），对 14 例原发性乳腺肿瘤样本进行 RNA-seq 比较分析，其中 7 例对治疗应答良好、7 例在内分泌治疗中出现疾病复发。数据以 log2 转换的 DESeq2 中位数比值归一化计数形式提供，覆盖 44934 个基因 ID，共 1 个文件（GSE214789_series_matrix.txt.gz）。可用于探索乳腺癌疾病进展相关的转录组差异，并支持治疗应答与复发相关的分类建模研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Oct 04 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：晚期乳腺癌的特征是肿瘤对治疗压力和转移微环境的适应性增强。通过对治疗应答良好的患者（n = 7）和内分泌治疗中出现疾病复发的患者（n = 7）进行比较 RNA-seq 分析，揭示了 14 例原发性乳腺肿瘤样本（n = 14 个样本）的转录组差异。RNA 测序数据以 log2 转换的中位数比值（DESeq2）归一化计数基因表达值形式存储（44934 个基因 ID；n = 14 个肿瘤样本）。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL20301、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE214789
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 15 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE214789
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
晚期乳腺癌的特征是肿瘤对治疗压力和转移微环境的适应性增强。通过对治疗反应良好的患者（n=7）和内分泌治疗期间出现疾病复发的患者（n=7）进行比较RNA-seq分析，揭示了14份原发乳腺肿瘤样本（n=14份样本）的转录组差异。RNA测序数据以log2转换的中位数比值（DESeq2）标准化计数基因表达值形式保存（44934个基因ID；n=14份肿瘤样本）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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