靶向三阴性乳腺癌细胞中的IRAK2降低体外细胞生长并延缓小鼠模型中的肿瘤进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213228

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数据说明

乳腺癌干细胞（BCSCs）是肿瘤复发和治疗耐药的原因。我们从三阴性乳腺癌（TNBC）患者肿瘤中建立了原代BCSC培养物，TNBC是乳腺癌的一个亚型，可能由BCSCs驱动。原代BCSCs产生的异种移植瘤可重现原发肿瘤的表型，是研究乳腺癌靶向策略的合适模型。在TNBC细胞系MDA-MB-468中，我们此前筛选了敲低后诱导分化反应的激酶，其中鉴定出IRAK2。由于IRAK2在原代BCSCs中高度富集，我们想知道其敲低是否会影响其生长。IRAK2下调的原代BCSCs和MDA-MB-468表现出增殖和成球能力下降，证明IRAK2在细胞生长和自我更新中的作用。当原位移植到免疫缺陷小鼠体内时，与对照细胞相比，IRAK2敲低细胞形成的异种移植瘤更小，提示IRAK2下调可能延缓肿瘤发展。

研究受敲低影响的分子通路发现，NF-κB和ERK磷酸化、IL-6和cyclin D1表达、ERN1信号传导及自噬均以细胞系依赖的方式降低。转录组分析证实，细胞受敲低影响的程度存在一定差异，表明其异质性、不同突变、遗传背景、IRAK2的表达及其下调水平可能影响敲低的结果。鉴于IRAK2整体下调降低了细胞维持侵袭性生长和耐受细胞应激的能力，IRAK2可被视为一个有趣的靶点，用以削弱TNBC进展，从而对TNBC的临床结局产生积极贡献。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。