乳腺癌治疗后十年有氧运动训练 rejuvenates 人体骨骼肌甲基化组

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数据说明

许多癌症幸存者存在骨骼肌（SkM）的损伤，表现为肌肉质量和功能的下降。有趣的是，人类骨骼肌对先前的刺激（如运动）具有表观遗传记忆。癌症存活后和/或运动训练后骨骼肌中表观遗传改变的长期保留尚未被研究。因此，我们研究了乳腺癌幸存者在诊断和治疗后10-14年，接受为期5个月、每周3次的跑台有氧训练干预后骨骼肌的全基因组DNA甲基化（甲基化组）。这些结果与保持未训练的乳腺癌幸存者以及无癌症病史、接受相同训练干预的年龄匹配对照者进行了比较。在5个月训练期之前（前）和之后（后）获取骨骼肌活检样本，并使用InfiniumEPIC 850K芯片分析DNA甲基化。与训练前的健康年龄匹配对照者相比，乳腺癌幸存者在大量差异甲基化位点（DMPs）上表现出DNA甲基化增加（即高甲基化）的显著保留。

与年龄匹配的健康对照者的训练相比，癌症幸存者的训练导致差异甲基化位点（DMPs）数量异常增多，并呈现高甲基化特征，这些位点更随机地分布在DNA上非调控区域。然而，在重要的基因调控区域情况相反，癌症幸存者的训练在特异位于启动子区CpG岛内的DMPs中，有99%出现了甲基化显著降低（即低甲基化）。重要的是，训练能够将癌症幸存者中识别出的高甲基化逆转回低甲基化特征，这种低甲基化特征是在训练前于年龄匹配的健康对照者中观察到的，涉及这些岛和启动子相关CpG位点中的300个（共881个）。通路富集分析表明，癌症幸存者的训练主要诱发了这种低甲基化特征，在p

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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