靶向雌激素诱导lncRNA BNAT1的siRNA处理人乳腺癌MCF7细胞的基因表达数据
该数据集来自NCBI GEO，收录人乳腺癌MCF7细胞经靶向雌激素诱导长链非编码RNA BNAT1（本数据集中别名基因名COL18AS）的siRNA处理后的基因表达谱，采用表达谱芯片平台GPL23126，物种为人（9606），共1个文件GSE212683_series_matrix.txt.gz
基本信息
资源简介
靶向雌激素诱导lncRNA BNAT1的siRNA处理人乳腺癌MCF7细胞的基因表达数据
Gene expression data from human breast cancer MCF7 cells treated with siRNAs targeting estrogen-inducible long non-coding RNA BNAT1 (breast cancer natural antisense transcript 1)
该数据集来自NCBI GEO，收录人乳腺癌MCF7细胞经靶向雌激素诱导长链非编码RNA BNAT1（本数据集中别名基因名COL18AS）的siRNA处理后的基因表达谱，采用表达谱芯片平台GPL23126，物种为人（9606），共1个文件GSE212683_series_matrix.txt.gz。研究背景为雌激素受体阳性乳腺癌的内分泌治疗耐药问题，BNAT1由COL18A1近端启动子区转录，siRNA沉默BNAT1可显著抑制他莫昔芬耐药MCF7细胞的体外与体内生长。数据可用于分析BNAT1在ER阳性乳腺癌中的表达调控作用及相关耐药机制研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Sep 04 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：内分泌治疗耐药是雌激素受体（ER）阳性乳腺癌临床管理中的一个难题。阐明调控ER信号的因子将为理解ER阳性和内分泌耐药乳腺癌的病理生理学提供有用信息。在针对由ERα相关活性启动子/增强子转录的雌激素诱导lncRNA的筛选中，在ER+ MCF7细胞中鉴定出一种新型雌激素诱导lncRNA BNAT1（breast cancer natural antisense transcript 1），其由COL18A1的近端启动子区转录。siRNA介导的BNAT1沉默显著抑制了他莫昔芬耐药MCF7细胞的体外和体内生长。为研究长链非编码RNA BNAT1（本数据集中使用别名基因名COL18AS）在ER+乳腺癌中的作用，用靶向BNAT1的siRNA（siCOL18
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL23126、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212683
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 01 202，引用时请注意版本时效。
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数据说明
内分泌治疗耐药是雌激素受体（ER）阳性乳腺癌治疗中的一个临床难题。阐明调控ER信号通路的因素，将为理解ER阳性和内分泌耐药乳腺癌的病理生理学提供有用信息。在从ERα相关的活性启动子/增强子转录的雌激素诱导型lncRNA筛选中，在ER+ MCF7细胞中鉴定出一种新型雌激素诱导型lncRNA BNAT1（乳腺癌天然反义转录本1），其转录自COL18A1的近端启动子区域。siRNA介导的BNAT1沉默显著抑制了他莫昔芬耐药的MCF7细胞的体外和体内生长。为探讨长链非编码RNA BNAT1（该数据集中使用别名基因名COL18AS）在ER+乳腺癌中的作用，用靶向BNAT1的siRNA（siCOL18AS或siBNAT1）或对照siRNA（siCtrl或siControl）处理MCF7细胞。微阵列研究表明，BNAT1与雌激素信号通路密切相关。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
