芳香化酶抑制剂治疗对乳腺癌基因表达的影响 [tissueseq]

该数据集来自 NCBI GEO,收录了接受辅助芳香化酶抑制剂(AI)治疗的雌激素受体阳性乳腺癌患者的肿瘤样本,通过 RNA 测序和基因表达谱分析,覆盖 14 个不同的乳腺肿瘤样本

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基因组预测GPL246769606
GSE206199: Effect of aromatase inhibitor (AI) treatment on gene expression of breast cancer [tissueseq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

芳香化酶抑制剂治疗对乳腺癌基因表达的影响 [tissueseq]

GSE206199 数据集来自 NCBI GEO,主题为芳香化酶抑制剂(AI)治疗对乳腺癌基因表达的影响。该数据集收录了接受辅助 AI 治疗的雌激素受体阳性乳腺癌患者的肿瘤样本,通过 RNA 测序和基因表达谱分析,覆盖 14 个不同的乳腺肿瘤样本,旨在考察 AI 治疗后肿瘤组织的表达谱特征。数据集以高通量测序表达谱分析为技术路线,属于肿瘤/乳腺癌分类,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE206199_series_matrix.txt.gz,由 Xueman、Chen 提交,发布时间为 Jun 15 202。

【数据集背景】

乳腺癌是常见的恶性肿瘤之一,其中雌激素受体阳性亚型在内分泌治疗中具有重要地位。芳香化酶抑制剂(AI)是绝经后雌激素受体阳性乳腺癌患者辅助内分泌治疗的重要药物类别,其通过抑制芳香化酶活性降低雌激素水平,从而影响肿瘤细胞的基因表达状态。该数据集正是围绕这一临床治疗场景构建,目的是研究接受辅助 AI 治疗的雌激素受体阳性乳腺癌患者的肿瘤样本在基因表达层面的变化特征,为理解 AI 治疗对乳腺癌组织转录组的影响提供数据基础。

【数据内容】

该数据集的核心内容是乳腺癌肿瘤样本的基因表达谱,来源于 RNA 测序。源站描述指出,研究者获取了接受辅助 AI 治疗的乳腺癌患者的肿瘤样本,并对 14 个不同的乳腺肿瘤样本进行了 RNA 测序和基因表达谱分析。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE206199_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件形式,通常用于汇总样本层面的表达信息。主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”、GPL24676 和 9606,分别对应高通量测序表达谱分析、平台编号和人类物种编号,表明数据以人类乳腺癌组织为研究对象,基于高通量测序平台产生表达谱数据。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为“Effect of aromatase inhibitor (AI) treatment on gene expression of breast cancer [tissueseq]”。样本来自接受辅助 AI 治疗的乳腺癌患者肿瘤组织,研究对 14 个不同的乳腺肿瘤样本进行了 RNA 测序与基因表达谱分析。数据集的作者为 Xueman、Chen,发布时间为 Jun 15 202。除上述信息外,样本的具体采集时间、采集地点、伦理审批信息以及患者临床特征等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与乳腺癌内分泌治疗相关的转录组研究场景,例如分析雌激素受体阳性乳腺癌患者在辅助 AI 治疗后肿瘤组织的基因表达谱特征,比较不同肿瘤样本之间的表达模式差异,或作为高通量测序表达谱分析的参考数据。由于数据聚焦于 AI 治疗后的乳腺癌组织,也可用于探索与芳香化酶抑制剂治疗反应相关的表达变化线索。需要说明的是,具体的研究设计细节、分组方式和对照设置,源站未提供,使用时应以原始数据文件中的实际内容为准。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE206199_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式,需按相应格式解压后读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据结构和注释信息无误后,再进行批量接入与分析。由于数据集仅包含 1 个系列矩阵文件,使用时应结合文件内的样本信息和表达数值进行整理,避免在未核对字段含义的情况下直接合并或转换数据。

【质量与限制】

该数据集样本量为 14 个乳腺肿瘤样本,属于较小规模的研究集合,在统计推断和泛化能力方面存在局限。数据仅包含 1 个文件,且以系列矩阵形式提供,可能不包含原始测序读段等更细粒度的数据。关于样本的临床信息、治疗时长、随访结果、对照样本设置以及数据质量控制指标等,源站未提供。此外,发布时间显示为 Jun 15 202,年份信息不完整,引用时需注意核对源站记录。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Xueman、Chen,来源站为 NCBI GEO。使用时应遵循源站的引用要求,引用数据集名称 GSE206199 及对应源站标题。关于数据许可条款、使用限制和具体引用格式,源站未提供,使用前应查阅 NCBI GEO 页面上的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206199

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了探究雌激素受体阳性乳腺癌在接受AI治疗后的表达谱,我们从接受辅助AI治疗的乳腺癌患者中获取了肿瘤样本,随后对14份不同的乳腺肿瘤样本进行了RNA测序和基因表达谱分析。

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