c-Jun对骨转移性luminal乳腺癌细胞系基因表达的影响
该数据集来自NCBI GEO，标题为c-Jun对骨转移性luminal乳腺癌细胞系基因表达的影响。研究通过建立表达显性负性c-Jun的MCF7-BM02-TAM67细胞系，利用高通量测序进行表达谱分析，以探究c-Jun在骨转移调控中的功能
基本信息
资源简介
c-Jun对骨转移性luminal乳腺癌细胞系基因表达的影响
GSE205924 数据集来自 NCBI GEO，标题为“c-Jun 对骨转移性 luminal 乳腺癌细胞系基因表达的影响”。该数据集属于肿瘤/乳腺癌分类，聚焦于 c-Jun 在骨转移调控中的功能研究。研究者建立了表达显性负性 c-Jun 的 MCF7-BM02-TAM67 细胞系，并利用高通量测序开展表达谱分析，以观察 c-Jun 受到抑制后基因表达的变化。数据集由 Yuxuan、Han 提交，发布时间为 Jun 11 202，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE205924_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL16791 和 9606。整体而言，该数据集为研究 c-Jun 在 luminal 乳腺癌骨转移中的转录调控作用提供了表达谱层面的数据基础。
【数据集背景】
骨转移是乳腺癌病程中的重要事件，而 luminal 型乳腺癌细胞系的骨转移调控机制涉及多种转录因子。c-Jun 作为转录调控相关因子，其在骨转移过程中的功能是本数据集关注的核心问题。为在细胞模型层面考察 c-Jun 的作用，研究者建立了表达显性负性 c-Jun 的 MCF7-BM02-TAM67 细胞系，通过干扰 c-Jun 的正常功能来观察下游基因表达的改变。该数据集的源站描述明确指出，研究目的是调查 c-Jun 在骨转移调控中的功能。数据集归入肿瘤/乳腺癌分类，主题标签中包含高通量测序表达谱分析以及人类物种标识 9606，说明其研究对象为人源细胞系的转录组表达情况。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE205924_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件。主题标签表明数据类型为 Expression profiling by high throughput sequencing，即基于高通量测序的表达谱分析；平台标识为 GPL16791；物种标识为 9606。源站描述提到研究建立了表达显性负性 c-Jun 的 MCF7-BM02-TAM67 细胞系，因此数据内容对应的是该细胞模型在 c-Jun 功能受干扰条件下的基因表达谱信息。除上述文件与标签信息外，源站未提供更细化的样本数量、分组设计或具体基因层面的结果描述。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。源站标题为“Effect of c-Jun on gene expression of bone metastatic luminal breast cancer cell line”，与数据集英文名一致。作者信息为 Yuxuan、Han，发布时间为 Jun 11 202。数据通过高通量测序方式采集表达谱信息，平台编号为 GPL16791，物种为 9606。研究材料为表达显性负性 c-Jun 的 MCF7-BM02-TAM67 细胞系，该细胞系用于探究 c-Jun 在骨转移调控中的功能。除上述来源信息外，源站未提供样本处理、测序策略或实验重复等更详细的采集说明。
【适用场景】
该数据集适用于围绕 c-Jun 与乳腺癌骨转移关系的表达谱分析场景。研究者可基于该数据考察在表达显性负性 c-Jun 的 MCF7-BM02-TAM67 细胞系中，基因表达相较对照条件可能发生的变化，从而为理解 c-Jun 在骨转移调控中的转录功能提供线索。由于数据主题标签为高通量测序表达谱，其典型用途包括差异表达分析、转录调控相关基因筛选以及骨转移相关通路层面的探索。该数据也可作为 luminal 型乳腺癌细胞系基因表达研究的参考数据之一。需要说明的是，具体分析设计应结合源站提供的原始信息进行，源站未提供的实验细节不宜在此推断。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE205924_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，读取前需按 GZIP 格式进行解压或直接以相应方式读取压缩文本。建议先在小样本上核对字段与编码，确认文件结构、样本标识与表达值编码无误后，再批量接入后续分析流程。由于该文件为系列矩阵文件，通常包含样本层面的表达谱矩阵信息，分析时可结合平台标识 GPL16791 与物种标识 9606 进行注释匹配。源站未提供更具体的读取脚本或分析参数，使用时应以文件实际内容为准。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE205924_series_matrix.txt.gz，源站未提供关于测序深度、重复数量、质控指标或数据完整性的进一步说明。研究基于表达显性负性 c-Jun 的 MCF7-BM02-TAM67 细胞系，属于特定细胞模型下的表达谱数据，其结果外推到其他乳腺癌亚型或体内骨转移情境时需谨慎。源站描述较为简短，未提供样本分组、对照设置与统计分析细节，因此在使用时对数据质量的判断应结合文件实际内容与源站原始记录进行。发布时间显示为 Jun 11 202，年份信息不完整，源站未提供更明确的时间说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Yuxuan、Han，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名为 GSE205924: Effect of c-Jun on gene expression of bone metastatic luminal breast cancer cell line。使用或引用时应注明该数据集名称与来源。源站未提供具体的许可条款或使用限制说明，相关许可信息需以 NCBI GEO 源站记录为准。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205924
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为研究c-Jun在骨转移调控中的功能，我们建立了表达显性负性c-Jun的MCF7-BM02-TAM67细胞系，随后利用3种不同细胞的RNA-seq数据进行了基因表达谱分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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