乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞经Galectin-1编程核心免疫抑制微环境
该数据集来自NCBI GEO,聚焦乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)经Galectin-1编程核心免疫抑制微环境的研究

基本信息
资源简介
乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞经Galectin-1编程核心免疫抑制微环境
Tumor associated macrophages-programmed core immunosuppressive microenvironments via Galectin-1 in breast cancer
该数据集来自NCBI GEO,聚焦乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)经Galectin-1编程核心免疫抑制微环境的研究。数据为小鼠乳腺癌早期进展阶段TAMs富集与耗竭样本的单细胞RNA测序表达谱,包含1个文件(GSE202624_series_matrix.txt.gz),可用于分析TAMs对肿瘤微环境重塑、癌细胞侵袭与EMT特征以及CD8+ T细胞应答的影响(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):人们对通过耗竭肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)或将其重极化为抗肿瘤表型来靶向治疗TAMs一直抱有浓厚兴趣。然而,TAMs介导肿瘤微环境重塑所利用的核心介质仍知之甚少。在此,为剖析TAMs介导的早期微环境,我们在肿瘤生长出现可检测变化之前的进展早期阶段,对TAMs富集和TAMs耗竭的小鼠乳腺肿瘤进行了单细胞RNA测序。我们发现,TAMs在肿瘤内的早期积累赋予癌细胞侵袭特性,以促进早期播散并削弱抗肿瘤T细胞应答。相应地,使用氯膦酸盐耗竭TAMs的肿瘤显示癌细胞上皮-间质转化(EMT)特征降低,并具有与CD8+ T细胞相关的独特转录组。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21273、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202624
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 11 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
目前,针对肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的治疗策略备受关注,主要集中于清除TAMs或将其重极化为抗肿瘤表型。然而,TAMs介导肿瘤微环境重塑所利用的核心介质仍知之甚少。为解析TAMs介导的早期微环境,我们在肿瘤进展早期、尚未出现可检测的肿瘤生长变化时,对富含TAMs和去除TAMs的小鼠乳腺肿瘤进行了单细胞RNA测序。我们发现,TAMs在瘤内的早期积聚赋予癌细胞侵袭特性,从而促进早期播散并抑制抗肿瘤T细胞应答。相应地,使用氯膦酸盐去除TAMs的肿瘤显示癌细胞上皮-间质转化(EMT)特征减弱,并具有与CD8+ T细胞活化相关的独特转录组。此外,我们确定了Galectin-1(Gal-1)作为TAMs诱导CD8+ T细胞耗竭的分子检查点的作用。
Gal-1抑制通过重新激活CD8+ T细胞逆转了免疫抑制,从而在乳腺肿瘤模型中抑制肿瘤生长并增强免疫检查点抑制剂的疗效。这些结果全面揭示了由TAMs早期编程的微环境,并揭示了一种免疫逃逸机制,该机制可被Gal-1靶向以激发抗肿瘤免疫反应。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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