GSE199822：侵袭伪足与细胞骨架调节因子CRP2诱导乳腺癌细胞促转移基质金属蛋白酶表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199822

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数据说明

肌动蛋白细胞骨架在癌细胞侵袭和转移中具有多种功能；然而这些功能如何协调仍不清楚。在细胞质中，肌动蛋白对于形成称为侵袭伪足的特化膜突起是必需的，这些突起集中并分泌细胞外基质降解酶，特别是基质金属蛋白酶（MMPs），从而促进肿瘤细胞侵袭。我们最近鉴定出富含半胱氨酸和甘氨酸蛋白2（CRP2）是一种肌动蛋白交联蛋白，其活性是侵袭伪足肌动蛋白骨架组装和延伸所必需的。在此，我们报告CRP2也位于乳腺癌细胞的细胞核中，以诱导一个互补的促转移基因表达程序，该程序主要与乳腺癌细胞侵袭和转移相关。我们在本研究中表明，CRP2与转录因子SRF和GATA3相互作用，分别调控MMP-9和MMP-13的表达。总体而言，我们的数据表明CRP2作为肿瘤细胞侵袭的关键介质发挥作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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