WDR5通过非KMT2依赖的翻译调控促进乳腺癌生长与转移
该数据集来自NCBI GEO(GSE196666),聚焦WDR5在乳腺癌生长与转移中的作用。研究通过体内遗传筛选发现WDR5是三阴性乳腺癌转移进展所需的关键表观遗传调控因子,并对WDR5敲低后的转移性乳腺癌细胞进行转录组测序分析

基本信息
资源简介
WDR5通过非KMT2依赖的翻译调控促进乳腺癌生长与转移
WDR5 promotes breast cancer growth and metastasis via KMT2-independent translation regulation
该数据集来自NCBI GEO(GSE196666),聚焦WDR5在乳腺癌生长与转移中的作用。研究通过体内遗传筛选发现WDR5是三阴性乳腺癌转移进展所需的关键表观遗传调控因子,并对WDR5敲低后的转移性乳腺癌细胞进行转录组测序分析。数据包含1个文件(GSE196666_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序表达谱,可用于探索WDR5调控的基因表达变化及其与乳腺癌转移的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 14 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:转移性乳腺癌仍是女性癌症相关死亡的主要原因,针对这一晚期疾病的有效疗法很少。利用体内遗传筛选,我们鉴定出WDR5是一个可靶向的表观遗传调控因子,在三阴性乳腺癌模型中为转移进展所必需。在此,我们分析了WDR5敲低后转移性乳腺癌细胞的转录组。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20301、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196666
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 30 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
目的:转移性乳腺癌仍然是女性癌症相关死亡的主要原因,针对这一晚期疾病的有效疗法很少。利用体内遗传筛选,我们在三阴性乳腺癌模型中鉴定出WDR5是一个可干预的表观遗传调控因子,为转移进展所必需。在此,我们分析了WDR5敲低后转移性乳腺癌细胞的转录组。方法:对乳腺癌细胞系MDA-MB-231 LM2、BoM、BrM3进行RNA-Seq分析。结果:我们发现WDR5直接控制核糖体基因的表达。结论:我们发现WDR5是乳腺癌转移的一个潜在靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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