乳腺癌细胞系MDA-MB-231异种移植基因表达谱-验证集

该数据集为乳腺癌细胞系MDA-MB-231异种移植模型的基因表达谱验证集,来源于NCBI GEO,包含1个系列矩阵文件。数据基于表达谱芯片平台,比较循环肿瘤细胞与实体原发/继发病灶的转录组,可用于研究血行播散相关基因、评估CTC特异性标志物及乳腺癌预后分析(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL149519606
GSE188897: Gene expression profile of breast cancer cell line MDA-MB-231 xenograft - validation set

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

乳腺癌细胞系MDA-MB-231异种移植基因表达谱-验证集

Gene expression profile of breast cancer cell line MDA-MB-231 xenograft - validation set

该数据集为乳腺癌细胞系MDA-MB-231异种移植模型的基因表达谱验证集,来源于NCBI GEO,包含1个系列矩阵文件。数据基于表达谱芯片平台,比较循环肿瘤细胞与实体原发/继发病灶的转录组,可用于研究血行播散相关基因、评估CTC特异性标志物及乳腺癌预后分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):进展为IV期疾病仍是乳腺癌相关死亡的主要原因。增加对转移血行阶段的认识,对于利用整个机会窗口干预早期播散并实现更有效的疾病控制至关重要。基于循环肿瘤细胞(CTC)的区分性分子特征可揭示关于转移生物学和疾病结局的有用信息这一假设,我们比较了MDA-MB-231异种移植模型中CTC与实体原发/继发病灶的转录组,并提供证据表明血行播散受众多基因调控。与常规CTC标志物相比,我们新的CTC特异性特征改善了早期乳腺癌患者的CTC检测和结局预后,并通过突出两个基因的作用揭示转移过程。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL14951、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE188897

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 02 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE188897

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

进展至IV期疾病仍是乳腺癌相关死亡的主要原因。深入了解转移的血行播散阶段,对于利用整个机会窗口干预早期播散并实现更有效的疾病控制至关重要。基于循环肿瘤细胞(CTCs)的独特分子特征可揭示转移生物学和疾病结局有用信息的假说,我们比较了MDA-MB-231异种移植模型中CTCs与实体原发/继发病灶的转录组,并提供证据表明血行播散受众多基因调控。与常规CTC标志物相比,我们新的CTC特异性特征改善了早期乳腺癌患者的CTC检测和结局预测,并通过突出两个基因的作用揭示了对转移过程的认识。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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