GSE185314:乳腺癌高风险原发性人乳腺细胞转录组多样性与体外行为特征

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE185314_series_matrix.txt.gz),聚焦乳腺癌高风险原发性人乳腺细胞的转录组多样性与体外行为

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基因组分类GPL111549606
GSE185314: Characterization of Transcriptome Diversity and In Vitro Behavior of Primary Human Breast Cells at Increased Risk for Breast Cancer Development

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

GSE185314:乳腺癌高风险原发性人乳腺细胞转录组多样性与体外行为特征

Characterization of Transcriptome Diversity and In Vitro Behavior of Primary Human Breast Cells at Increased Risk for Breast Cancer Development

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE185314_series_matrix.txt.gz),聚焦乳腺癌高风险原发性人乳腺细胞的转录组多样性与体外行为。样本包括 27 例来自乳腺癌同侧的非癌来源乳腺上皮细胞(高风险细胞)、8 例癌症样本、3 例对侧非癌样本和 1 例预防性乳房切除非癌样本。数据可用于分析体外行为差异与基线转录组特征的关联,并探索高风险与癌症样本中妊娠发育基因的异常表达模式(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 05 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):研究非癌性高风险人乳腺上皮细胞的特性受到获取原代上皮细胞用于研究的限制。在此,我们使用条件重编程细胞(CRC)技术分离了 n=27 份来自乳腺癌同侧的非癌来源乳腺上皮细胞连续样本,这些细胞被认为是未来乳腺癌发生的高风险细胞。比较样本包括癌症(n=8)、对侧(n=3)和预防性乳房切除(n=1)的非癌来源乳腺上皮细胞。样本间显著的体外行为差异与基线转录组特征相关联。一项探索性分析在高风险样本和癌症样本中均识别出妊娠发育基因异常表达的模式。总之,利用人原代乳腺细胞来研究乳腺癌风险是可能的。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE185314

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 28 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

研究非癌性高风险人乳腺上皮细胞的特性,受到难以获取原代上皮细胞用于研究的限制。本研究采用条件重编程细胞(CRC)技术,分离了n=27份来自乳腺癌同侧、非癌来源的乳腺上皮细胞连续样本,这些细胞被认为是未来乳腺癌发生的高风险细胞。对照样本包括癌症来源(n=8)、对侧非癌来源(n=3)以及预防性乳房切除术非癌来源(n=1)的乳腺上皮细胞。样本间显著的体外行为差异与基线转录组特征相关。一项探索性分析在风险样本和癌症样本中均发现了妊娠发育基因异常表达的模式。总之,利用人原代乳腺上皮细胞开展靶向体外和遗传学研究,以探讨乳腺癌风险是可行的。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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