接受新辅助卡铂和多西他赛治疗的三阴性乳腺癌队列的Pam50(按Lehmann精细分类)

GSE181548:接受新辅助卡铂和多西他赛治疗的三阴性乳腺癌队列的Pam50(按Lehmann精细分类)。主题标签:三阴性乳腺癌、Pam50、Lehmann分类、新辅助治疗、卡铂、多西他赛、肿瘤

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基因组分类三阴性乳腺癌Pam50Lehmann分类新辅助治疗卡铂多西他赛肿瘤
GSE181548: Pam50 of a Triple-Negative Breast Cancer Cohort Treated with Neoadjuvant Carboplatin and Docetaxel According to Lehmann's Refined Classification

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

接受新辅助卡铂和多西他赛治疗的三阴性乳腺癌队列的Pam50(按Lehmann精细分类)

GSE181548 是一个聚焦三阴性乳腺癌的基因表达数据集,其全称为“Pam50 of a Triple-Negative Breast Cancer Cohort Treated with Neoadjuvant Carboplatin and Docetaxel According to Lehmann's Refined Classification”。该数据集围绕接受新辅助卡铂联合多西他赛治疗的三阴性乳腺癌队列展开,采用 PAM50 分型框架,并结合 Lehmann 精细分类对队列进行刻画。数据集归属于肿瘤/乳腺癌分类,来源站为 usebiotransfer.org。其主题标签涵盖三阴性乳腺癌、Pam50、Lehmann 分类、新辅助治疗、卡铂、多西他赛与肿瘤,便于在相关研究场景中检索与定位。整体而言,该数据集为研究三阴性乳腺癌在新辅助化疗背景下的分子分型特征提供了可参考的数据资源。

【数据集背景】

三阴性乳腺癌是乳腺癌中异质性较强、治疗选择相对有限的一种亚型。新辅助治疗即在手术前给予系统性药物治疗,是局部晚期乳腺癌常用的治疗策略之一,其病理反应常被用作评估药物敏感性的重要参考。卡铂与多西他赛联合方案是该背景下的一种治疗组合。PAM50 是一种基于基因表达谱的乳腺癌分子分型方法,可将肿瘤划分为若干内在亚型;Lehmann 精细分类则针对三阴性乳腺癌提出更细化的分子亚型划分框架。GSE181548 正是在这一研究脉络下,将 PAM50 分型与 Lehmann 精细分类结合,用于描述接受新辅助卡铂和多西他赛治疗的三阴性乳腺癌队列。

【数据内容】

该数据集的核心内容为三阴性乳腺癌队列的 PAM50 分型信息,并按照 Lehmann 精细分类进行组织与呈现。数据集名称明确指向“Pam50”与“Lehmann's Refined Classification”,表明其数据围绕分子分型结果展开。关于具体的样本数量、基因表达矩阵的维度、平台信息、临床变量种类以及分型结果的分布情况,源站未提供。数据集的主题标签包括三阴性乳腺癌、Pam50、Lehmann 分类、新辅助治疗、卡铂、多西他赛与肿瘤,可作为理解其内容范围的线索。

【采集与来源】

该数据集来源于 usebiotransfer.org,数据集英文名为 GSE181548: Pam50 of a Triple-Negative Breast Cancer Cohort Treated with Neoadjuvant Carboplatin and Docetaxel According to Lehmann's Refined Classification。源站对该数据集的描述为“GSE181548: Pam50 of a Triple-Negative Breast Cancer Cohort Treated with...”,其余描述信息未完整呈现。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序或芯片平台的具体型号,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与三阴性乳腺癌分子分型相关的研究场景,例如探讨 PAM50 分型与 Lehmann 精细分类之间的关系,或在接受新辅助卡铂和多西他赛治疗的队列背景下分析不同分子亚型的分布特征。也可用于乳腺癌生物信息学分析中的分型注释参考、方法学比较以及与其他三阴性乳腺癌队列的对照研究。关于该数据集是否适合生存分析、疗效预测建模或跨平台整合分析,源站未提供明确说明,使用者应结合数据实际内容审慎判断。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据其 PAM50 分型与 Lehmann 精细分类信息开展分组比较或分型注释。由于数据集名称强调分型框架,分析中应注意区分 PAM50 内在亚型与 Lehmann 精细分类亚型这两套体系,避免混淆。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法以及配套分析代码,源站未提供,需以源站实际提供的说明为准。

【质量与限制】

该数据集基于特定治疗背景下的三阴性乳腺癌队列,其分型结果与治疗方案的关联性需要在相应背景下解读。关于样本量大小、数据完整性、缺失值情况、批次效应以及分型判定的阈值标准,源站未提供。使用者应注意,数据集名称所反映的分型信息不等同于完整的临床随访或疗效数据,相关结论的外推需谨慎。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及原始发表文献信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应查阅来源站 usebiotransfer.org 的相关说明,并遵循其规定的引用与许可要求。

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使用方式

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源站:https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE181548

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

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