热休克因子1支持乳腺癌中ESR1作用的RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159802

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

热休克因子1（HSF1）是蛋白质毒性应激转录反应的关键调控因子。近期研究发现其与通过ESR1介导的雌激素信号传导相关。为研究HSF1与ESR1在雌激素转录反应中的协同作用，我们采用特异性shRNA或CRISPR/Cas9方法建立了HSF1水平降低的雌激素受体（ER）阳性乳腺癌细胞系。HSF1缺陷导致MCF7和T47D细胞中雌激素促有丝分裂效应的抑制。RNA-seq分析显示，在HSF1缺陷的MCF7细胞中，E2对转录组的刺激效应较小。ChIP-seq分析揭示，这在一定程度上可能是由于这些细胞中未配体结合的ESR1与染色质结合增强，导致E2依赖性基因的基础表达升高。因此，我们推测部分ESR1可能从与HSP90的抑制性复合物中释放，并在无E2刺激的情况下获得转录能力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。