GSE156941:HIF1A信号选择性支持乳腺癌脑内增殖(脑 vs 乳腺脂肪垫)

数据基于高通量测序表达谱(GPL18573,9606),比较乳腺癌细胞在脑与乳腺脂肪垫中的生长差异,涉及循环肿瘤细胞(CTCs)颅内接种及衍生细胞系

geo
浏览 6
时间序列分类GPL185739606
GSE156941: HIF1A signaling selectively supports proliferation of breast cancer in the brain [brain vs mammary fat pad]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE156941:HIF1A信号选择性支持乳腺癌脑内增殖(脑 vs 乳腺脂肪垫)

HIF1A signaling selectively supports proliferation of breast cancer in the brain [brain vs mammary fat pad]

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE156941_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/乳腺癌。数据基于高通量测序表达谱(GPL18573,9606),比较乳腺癌细胞在脑与乳腺脂肪垫中的生长差异,涉及循环肿瘤细胞(CTCs)颅内接种及衍生细胞系。可用于研究HIF1A信号通路对脑转移增殖的选择性支持作用,以及筛选脑转移相关表达特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):血行转移至脑是乳腺癌的主要并发症,但使癌细胞能够选择性地在脑微环境中生长的细胞通路尚知之甚少。我们发现,从晚期乳腺癌女性血液样本中衍生并在体外培养的循环肿瘤细胞(CTCs),直接接种到小鼠额叶后,在脑内表现出显著的增殖潜力差异。通过连续颅内注射产生的衍生细胞系获得了选择性的脑内增殖能力增强,同时原位肿瘤生长减少。增加的缺氧诱导因子1A(HIF1A)相关信号与脑内增殖增强相关,而shRNA介导的HIF1A抑制或HIF相关糖酵解途径的药物抑制选择性地损害脑肿瘤生长,同时对乳腺

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE156941

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 12 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE156941

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血行转移至脑是乳腺癌的主要并发症,但使癌细胞能够选择性地在脑微环境中生长的细胞通路尚知之甚少。我们发现,从晚期乳腺癌女性血液样本中获取并在体外培养的循环肿瘤细胞(CTCs),直接接种到小鼠额叶后,在大脑中的增殖潜能表现出显著差异。通过连续颅内注射产生的衍生细胞系在大脑中获得了选择性的增殖能力增强,同时原位肿瘤生长减弱。缺氧诱导因子1A(HIF1A)相关信号通路的增强与大脑中增殖能力的提高相关,而shRNA介导的HIF1A抑制或HIF相关糖酵解途径的药物抑制可选择性地损害脑肿瘤生长,同时对乳腺肿瘤生长的影响极小。在临床标本中,与配对的原发性乳腺肿瘤相比,脑转移灶的HIF1A蛋白表达升高;且在脑转移患者中,CTCs的缺氧信号可预测总生存期缩短。

转移至脑部的癌症对缺氧信号的选择性激活可能为治疗干预提供机会。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案