犬与人乳腺癌细胞系获得性放射抗性发展的比较分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE149988

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：使用体外犬乳腺癌细胞系开展的研究以及涉及自然发生犬乳腺肿瘤的研究，不仅是增进对兽医患者癌症认识的基础模型，也被视为人类乳腺癌的优良转化模型。在人类医学中，乳腺癌在疾病分类和分期之后通常采用包括放疗在内的多模式治疗。乳腺肿瘤对放射治疗的反应不仅取决于其固有的放射敏感性，还取决于已产生放射抗性的细胞所导致的肿瘤再增殖。通过比较犬与人类研究来探究放射抗性的分子机制，可能促成对两个物种均有益的有效癌症治疗方法的开发。方法：通过使亲本细胞每周接受递增剂量的辐射，建立了人类（MDA-MB-231、MCF-7和ZR-751）和犬（REM-134）放射抗性细胞系。通过增殖实验和集落形成实验评估放射抗性的形成。表型特征分析包括迁移实验、侵袭实验和免疫组织化学。

通过全转录组基因表达分析，研究了亲本细胞与放射抵抗细胞之间的内在差异。基因富集和通路聚焦分析确定了在放射抵抗细胞中差异激活的信号网络。结果：集落形成实验在人源和犬源亲本细胞系中鉴定出一系列内在放射敏感性，其中REM-134细胞系与人源细胞系相比显示出显著更强的放射抵抗性。集落形成和增殖实验证实了所有已建立的放射抵抗细胞系均具有放射抵抗性。放射抵抗细胞表现出增强的迁移和侵袭能力，并有上皮-间质转化的证据。基因分析发现，在MCF-7和

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。