癌症干细胞样逆转项目单细胞RNA测序数据
该数据集为癌症干细胞样逆转项目的单细胞RNA测序数据，来源于原发性乳腺癌患者的恶性胸腔积液或腹水样本。样本经红细胞去除、死细胞及CD45+细胞清除后，将纯化的患者细胞在Renaissance培养基（3D）中培养，先用化疗药物处理72小时，再换含DMSO或belinostat的培养基继续培养72小时，
基本信息
资源简介
癌症干细胞样逆转项目单细胞RNA测序数据
Single Cell RNA-Seq data for Cancer Stem Like Reversal Project
该数据集为癌症干细胞样逆转项目的单细胞RNA测序数据，来源于原发性乳腺癌患者的恶性胸腔积液或腹水样本。样本经红细胞去除、死细胞及CD45+细胞清除后，将纯化的患者细胞在Renaissance培养基（3D）中培养，先用化疗药物处理72小时，再换含DMSO或belinostat的培养基继续培养72小时，最后收集细胞并通过ICELL8®单细胞系统进行测序。数据可用于研究乳腺癌细胞在化疗及表观遗传药物处理下的单细胞转录组表达特征（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 21 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：原发性乳腺癌样本取自恶性胸腔积液或腹水，经完全去除红细胞后获得。对于单细胞RNA测序，将冻存管解冻，在去除死细胞和CD45+细胞后获得有活力的乳腺癌细胞。纯化的患者细胞在Renaissance培养基（3D）中培养，并用化疗药物（多柔比星0.1 µM、卡铂0.1 mM、紫杉醇1 µM）处理72小时，然后替换为含DMSO/belinostat（1 µM）的Renaissance培养基孵育72小时。收集细胞，用Dead Cell Removal Kit纯化，并上机ICELL8®单细胞系统。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE147326
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 22 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
原发乳腺癌样本取自恶性胸腔积液或腹水，经完全去除红细胞后获得。对于单细胞RNA测序，将冻存管解冻，去除死细胞和CD45+细胞后获得存活的乳腺癌细胞。纯化后的患者细胞在Renaissance培养基（3D）中培养，并用化疗药物（多柔比星0.1 µM、卡铂0.1 mM、紫杉醇1 µM）处理72小时，然后更换为含DMSO/belinostat（1 µM）的Renaissance培养基孵育72小时。收集细胞，用死细胞去除试剂盒纯化，并进行ICELL8®单细胞系统处理。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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