骨转移来源乳腺癌PDX模型及匹配人乳腺原发肿瘤的表达数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146661

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

相当比例的雌激素受体（ER）阳性乳腺癌（BC）患者会对内分泌治疗（ET）产生耐药，并出现转移性疾病复发。骨是ER+患者最常见的转移部位，然而骨转移灶的活检和分析在技术上具有挑战性。困难既涉及肿瘤组织的获取，也涉及分析和RNA提取的技术。乳腺癌骨转移的患者来源异种移植（PDX）模型尚未见报道。我们首次从接受椎体成形术治疗、在内分泌治疗期间出现疾病进展的患者的骨转移活检组织中建立了PDX模型。我们对PDX模型进行了转录组水平分析，并将其与患者的早期原发肿瘤进行比较，以识别与转移背景下内分泌耐药相关的新治疗靶点。通过将骨转移来源的PDX与患者原发乳腺肿瘤进行比较转录组分析，鉴定骨转移中激活的信号通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。