GSE143586：异位Osx+细胞影响肿瘤生长

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE143586

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数据说明

肿瘤生长和转移依赖于癌细胞与局部环境之间的相互作用。细胞间黏附分子N-钙黏蛋白（Ncad）的表达与高侵袭性癌症相关，有研究提出，成骨细胞表达Ncad可为播散性肿瘤细胞提供分子“停靠点”，以在骨内建立转移前微环境。与预期相反，乳腺癌细胞在Cdh2-cKO小鼠和对照小鼠中均能形成骨肿瘤并诱导骨溶解。值得注意的是，与对照同窝小鼠相比，Cdh2-cKO小鼠的皮下肿瘤生长更大。使用Ai9报告基因进行的细胞追踪实验显示，骨外肿瘤基质中存在Osx+和Ncad+细胞，肺细胞中亦存在一小群此类细胞，而肺是乳腺癌转移的常见部位。通过RNAseq对从骨外肿瘤中分离的CD45- Osx+细胞进行基因表达分析，结果显示，与对照Osx+细胞相比，Cdh2-cKO细胞的促肿瘤信号通路发生改变。

同样令人惊讶的是，我们在循环系统中发现了Osx+细胞，而且大多数肿瘤相关和循环中的Osx+细胞表达造血标志物CD45，其表型特征类似于肿瘤浸润的髓系和淋系细胞群，但淋巴细胞免疫抑制基因的表达更高。我们的结果表明，Osx标记了不同的促肿瘤CD45-和CD45+细胞群，并挑战了成骨标志物与造血标志物互斥的教条。研究还表明，CD45- Osx+细胞中的Ncad对于骨转移的建立并非必需，但在骨外肿瘤中，它通过微环境调控促肿瘤支持作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。