乳腺癌他莫昔芬单药治疗显微切割肿瘤活检数据集

资源简介

乳腺癌他莫昔芬单药治疗显微切割肿瘤活检数据集

GSE1378 是一个聚焦乳腺癌内分泌治疗场景的基因表达谱数据集，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），主题为 ER 阳性原发性乳腺癌患者接受他莫昔芬单药治疗后的表达特征。该数据集共纳入 60 例 ER 阳性原发性乳腺癌患者，治疗方式为他莫昔芬单药治疗并持续 5 年，数据由 LCMed 癌细胞产生，并以表达谱芯片形式组织。数据集整体以单个文件形式提供，文件名为 GSE1378_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式，便于下载与本地读取。对于关注乳腺癌内分泌治疗反应、ER 阳性肿瘤表达特征以及芯片表达谱分析的研究者而言，该数据集提供了一个以临床治疗背景明确、样本来源限定为微切割肿瘤活检组织的表达谱资源。

【数据集背景】

该数据集对应源站标题为“breast cancer / tamoxifen monotherapy (microdissected tumor biopsies)”，英文名称为 GSE1378。其研究背景集中在 ER 阳性原发性乳腺癌患者接受他莫昔芬单药治疗的情形，治疗持续时间为 5 年。数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签包括 Expression profiling by array、GPL1223 与 9606，说明其数据类型为基于芯片的表达谱检测，涉及平台编号 GPL1223，物种编号 9606 对应人类。作者为 Xiao-Jun，Ma，发布时间为 May 07 200。

【数据内容】

数据集包含 60 例 ER 阳性原发性乳腺癌患者的表达谱数据，这些患者均接受他莫昔芬单药治疗 5 年。数据由 LCMed 癌细胞产生，源站标题同时指明样本来自微切割的肿瘤活检组织。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE1378_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。主题标签中的 Expression profiling by array 表明数据以芯片表达谱形式呈现，GPL1223 为相关平台标识，9606 为人类物种标识。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述指出，该数据集覆盖 60 例 ER 阳性原发性乳腺癌患者，接受他莫昔芬单药治疗 5 年，数据由 LCMed 癌细胞生成。作者信息为 Xiao-Jun，Ma，发布时间为 May 07 200。样本类型在源站标题中表述为微切割肿瘤活检组织（microdissected tumor biopsies）。除上述信息外，源站未提供更详细的采集地点、采集时间、伦理审批或样本处理流程等信息。

【适用场景】

该数据集适用于围绕 ER 阳性原发性乳腺癌与他莫昔芬单药治疗背景的表达谱分析，可用于芯片表达数据的读取、字段核对与批量接入等通用数据处理流程。由于其样本限定为接受他莫昔芬单药治疗 5 年的 ER 阳性原发性乳腺癌患者，且数据由 LCMed 癌细胞产生，适合在明确治疗背景与样本来源的前提下开展表达特征层面的探索。具体分析目标与研究设计需结合使用者自身需求确定，源站未提供针对特定分析场景的说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE1378_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因字段解析或编码不一致导致后续处理偏差。数据集仅包含 1 个文件，文件组织相对简单，读取时需注意压缩包的解压与文本矩阵的解析。源站未提供额外的使用步骤、软件依赖或参数配置说明。

【质量与限制】

数据集样本量为 60 例，均来自 ER 阳性原发性乳腺癌患者并接受他莫昔芬单药治疗 5 年，样本来源为微切割肿瘤活检组织，数据由 LCMed 癌细胞产生。文件数量为 1，格式为 GZIP 压缩包。除上述信息外，源站未提供关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应、平台注释完整度或验证实验等方面的说明，使用时应结合自身分析目的谨慎判断。

【引用与许可】

作者为 Xiao-Jun，Ma，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 May 07 200。源站未提供具体的引用格式、许可条款或使用限制说明。