CDK4/6抑制对早期乳腺癌短期和长期影响

该数据集来自NCBI GEO,包含一项关于CDK4/6抑制剂palbociclib对早期乳腺癌短期和长期影响的研究。研究使用MCFDCIS(ER阴性基底型)和MCF7(ER阳性管腔型)模型,通过高通量测序进行表达谱分析,探究palbociclib对导管原位癌进展和浸润性生长的抑制作用,以及其对细胞周

geo
浏览 5
基因组分类GPL111549606
GSE130903: Short and long-term effects of CDK4/6 inhibition on early stage breast cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

CDK4/6抑制对早期乳腺癌短期和长期影响

Short and long-term effects of CDK4/6 inhibition on early stage breast cancer

该数据集来自NCBI GEO,包含一项关于CDK4/6抑制剂palbociclib对早期乳腺癌短期和长期影响的研究。研究使用MCFDCIS(ER阴性基底型)和MCF7(ER阳性管腔型)模型,通过高通量测序进行表达谱分析,探究palbociclib对导管原位癌进展和浸润性生长的抑制作用,以及其对细胞周期基因表达、增殖、衰老和肿瘤球形成的影响。数据可用于分析CDK4/6抑制在早期乳腺癌中的转录组变化及肿瘤与基质细胞区室的表达特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 08 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):CDK4/6抑制剂用于晚期雌激素受体(ER)(+)乳腺癌(BC)的治疗。其在ER(-)和早期BC中的疗效目前正在研究中。在此,我们显示palbociclib,一种CDK4/6抑制剂,可以在ER(-)基底BC模型(MCFDCIS)和ER(+)管腔模型(MCF7导管内注射)中抑制导管原位癌(DCIS)的进展和浸润性疾病的生长。在MCFDCIS细胞中,palbociclib抑制细胞周期基因表达,抑制增殖,诱导衰老并使Matrigel中形成的肿瘤球正常化,而正常乳腺上皮细胞(MCF10A)的腺泡形成未受影响。用palbociclib治疗携带MCFDCIS肿瘤的小鼠抑制了其恶性进展并减少了浸润性病变的增殖。肿瘤和基质细胞区室的转录组分析显示细胞周期

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130903

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 01 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130903

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CDK4/6抑制剂用于治疗晚期雌激素受体(ER)阳性乳腺癌(BC)。其在ER阴性及早期乳腺癌中的疗效目前正在研究中。在此,我们展示帕博西尼(palbociclib),一种CDK4/6抑制剂,能够在ER阴性基底型乳腺癌模型(MCFDCIS)和ER阳性管腔型模型(MCF7导管内注射)中抑制导管原位癌(DCIS)的进展以及浸润性疾病的生长。在MCFDCIS细胞中,帕博西尼抑制了细胞周期基因表达,抑制了增殖,诱导了衰老,并使在Matrigel中形成的肿瘤球正常化,而正常乳腺上皮细胞(MCF10A)形成腺泡的过程未受影响。对携带MCFDCIS肿瘤的小鼠进行帕博西尼治疗,抑制了其恶性进展并减少了浸润性病变的增殖。对肿瘤和基质细胞区室的转录组分析显示,治疗期间细胞周期和衰老基因以及MUC16(一种卵巢癌生物标志物基因)被抑制。在MCFDCIS细胞中敲低MUC16抑制了浸润性病变的增殖,但未抑制DCIS的进展。停止帕博西尼治疗后,与分化相关的基因,例如

p63、炎症、IFNγ反应以及抗原加工和呈递在肿瘤及周围基质中仍处于抑制状态。我们得出结论,palbociclib可阻止DCIS进展,并对ER(-)浸润性疾病具有抗增殖作用,部分通过MUC16介导。停药后CDK4/6抑制对分化和免疫反应的持久影响可能影响早期ER(-)乳腺癌的治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。