人淋巴管肌瘤病（LAM）结节转录谱数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE12027

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

淋巴管肌瘤病（LAM）的特征是由平滑肌样LAM细胞导致的囊性肺破坏，这些细胞在肿瘤抑制基因结节性硬化症复合体（TSC）1或2中存在突变，并具有转移能力。鉴于趋化因子及其受体在转移细胞的趋化作用中发挥作用，我们假设LAM细胞可能被肺部的趋化因子招募。对LAM患者和健康志愿者支气管肺泡灌洗液中25种趋化因子的定量分析显示，LAM患者样本中MCP-1/CCL2、GROα/CXCL1和ENA-78/CXCL5的浓度显著高于健康志愿者。在此转录本分析中，LAM细胞中趋化因子及趋化因子受体mRNA的表达与黑色素瘤细胞和平滑肌细胞不同。随后对30例LAM患者肺切片进行的免疫组化证实，趋化因子及其受体的蛋白表达在LAM患者间存在差异，且与乳腺癌和黑色素瘤细胞中所见不同。

体外实验中，MCP-1/CCL2诱导了从移植的LAM肺组织生长出的异质性细胞群体中表现出TSC2杂合性缺失的细胞的选择性迁移。此外，MCP-1基因启动子区域单核苷酸多态性的频率在LAM患者和健康志愿者之间存在显著差异（p=0.018），且其中一种多态性与肺功能下降的关联显著更为频繁。这些观察结果与以下观点一致：诸如MCP-1之类的趋化因子可能有助于确定LAM细胞转移的部位。关键词：人类患者样本与细胞系的比较

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。