CAFs诱导的人乳腺癌细胞系DCIS表达数据

该数据集来自NCBI GEO,包含经癌相关成纤维细胞(CAFs)诱导的人乳腺癌细胞系DCIS的基因表达谱,使用GPL570芯片平台,物种为9606(人),共1个文件

geo
浏览 5
基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE119253: Expression data from human  breast cancer cell line DCIS educated by CAFs

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

CAFs诱导的人乳腺癌细胞系DCIS表达数据

Expression data from human breast cancer cell line DCIS educated by CAFs

该数据集来自NCBI GEO,包含经癌相关成纤维细胞(CAFs)诱导的人乳腺癌细胞系DCIS的基因表达谱,使用GPL570芯片平台,物种为9606(人),共1个文件。数据可用于研究CAFs对肿瘤细胞上皮-间质可塑性的影响,以及肿瘤细胞簇形成和转移相关基因表达变化,支持乳腺癌微环境与转移机制的转录组分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 30 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):新兴证据支持多细胞肿瘤簇侵入并播种转移的假说。然而,肿瘤相关基质是否诱导肿瘤细胞簇中的上皮-间质可塑性,以促进侵袭和转移,仍不清楚。我们在此证明,肿瘤基质中常见的癌相关成纤维细胞(CAFs)驱动形成由两种不同癌细胞群体组成的肿瘤细胞簇,一种处于高度上皮(E-cadherin-high ZEB1-low/neg: E-hi)状态,另一种处于混合上皮/间质(E-cadherin-low ZEB1-high: E/M)状态。E-hi细胞高表达致癌性细胞-细胞黏附分子,如与E-cadherin相关的癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)和CEACAM6,导致肿瘤细胞簇形成和转移播种增加。E/M细胞也

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119253

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 07 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119253

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

新出现的证据支持多细胞肿瘤簇侵入并播散转移的假说。然而,肿瘤相关间质是否诱导肿瘤细胞簇发生上皮-间质可塑性,从而促进侵袭和转移,仍属未知。我们在此证明,肿瘤间质中常见的癌相关成纤维细胞(CAFs)驱动形成由两种不同癌细胞群体组成的肿瘤细胞簇,一种处于高度上皮(E-cadherin高 ZEB1低/阴性:E-hi)状态,另一种处于混合上皮/间质(E-cadherin低 ZEB1高:E/M)状态。E-hi细胞高表达致癌性细胞-细胞黏附分子,如与E-cadherin结合的癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)和CEACAM6,导致肿瘤细胞簇形成和转移播散增加。E/M细胞亦与E-hi细胞保持连接,E-hi细胞跟随E/M细胞导致集体侵袭。CAF产生的间质细胞衍生因子1和转化生长因子-b通过Src激活在相邻的人乳腺肿瘤细胞中赋予E-hi和E/M状态以及侵袭和转移特征。

综上所述,这些发现表明,侵袭性和转移性肿瘤细胞簇是由CAFs通过上皮-间质可塑性诱导产生的。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。