乳腺癌与器官微环境转录组在转移中的分离
该数据集来自NCBI,包含人乳腺癌患者来源异种移植(PDX)转移模型的RNA测序数据,覆盖乳腺肿瘤及肝、肺、脑转移灶,用于识别介导转移生长的癌症与器官特异性遗传特性

基本信息
资源简介
乳腺癌与器官微环境转录组在转移中的分离
Separation of breast cancer and organ microenvironment transcriptomes in metastases
该数据集来自NCBI,包含人乳腺癌患者来源异种移植(PDX)转移模型的RNA测序数据,覆盖乳腺肿瘤及肝、肺、脑转移灶,用于识别介导转移生长的癌症与器官特异性遗传特性。研究发现肝、肺微环境的遗传变化比癌细胞转录组更一致且幅度更大,并整合肝微环境遗传数据。数据可用于研究转移微环境机制及乳腺癌转移相关基因表达分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 22 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):种子与土壤假说在一个多世纪前被提出,用以描述为何癌细胞(种子)在特定器官(土壤)中生长。此后,定义癌细胞的遗传特性已被大量研究,然而,器官微环境中介导成功转移生长的遗传介质了解较少。在这些研究中,使用了一组人乳腺癌患者来源异种移植(PDX)转移模型。对乳腺肿瘤及肝、肺、脑转移灶进行了RNA测序,目的是识别介导转移生长的互补性癌症与器官特异性遗传特性。在PDX转移生长过程中,肝和肺微环境中发生的遗传变化比癌细胞转录组更一致且幅度更大。整合肝微环境遗传
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL17021、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE118942
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 10 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
种子与土壤假说在一个多世纪前被提出,用以描述为何癌细胞(种子)会在特定器官(土壤)中生长。此后,界定癌细胞的遗传特性得到了大量研究,然而,介导成功转移性生长的器官微环境内的遗传介导因素却了解较少。在这些研究中,使用了一组人乳腺癌患者来源异种移植(PDX)转移模型。对乳腺肿瘤以及肝、肺和脑转移灶进行了RNA测序,目的是识别介导转移性生长的互补性癌症与器官特异性遗传特性。在PDX的转移性生长过程中,肝和肺微环境中发生的遗传变化比癌细胞转录组更一致且幅度更大。将肝微环境基因特征整合到肝转移尸检样本或细针穿刺样本的遗传数据中,揭示了微环境对转移转录组的贡献。这些见解识别了转移的癌症与器官特异性遗传驱动因素。
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