IV期乳腺癌循环肿瘤细胞与转移灶全转录组比较

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数据说明

转移是导致绝大多数乳腺癌相关死亡的原因。转移性乳腺癌（MBC）与原发性乳腺癌（BC）存在本质差异，其在不同器官部位或全身治疗过程中处于选择压力下发生演变。现行ASCO指南要求对转移灶进行活检，以指导全身治疗的决策。然而，在临床实践中，对大转移灶进行活检往往不可行。循环肿瘤细胞（CTC）已被证明在MBC中具有预后价值，但其作为超越CTC计数的临床生物标志物的应用仍然有限。相较于转移灶，更深入地理解CTC生物学可能为治疗机会提供启示，并有助于推动CTC作为液体活检在临床实践中的应用。ANGLE Parsortix系统是一种微流控装置，基于大小和可变形性分离CTC，无需进行细胞表面标志物选择。我们实验室此前已证明对稀有CTC进行基因表达谱分析的可行性。

在此，我们评估了ANGLE Parsortix系统分离的循环肿瘤细胞（CTC）的全转录组测序（RNA Seq）基因表达谱是否可作为大转移灶活检的替代指标。通过ANGLE Parsortix系统，从21例转移性乳腺癌（MBC）患者的10mL外周血（PB）中计数并捕获CTC。对所有患者的新鲜转移性肿瘤活检组织（mets）、CTC及外周血进行了RNA Seq检测。活检部位包括：皮肤（n=1）、肺（n=1）、胸腔积液（n=5）、心包积液（n=1）、乳腺（n=3）、淋巴结（n=2）、脑（n=4）、肝（n=1）、腹水（n=3）、脑脊液（n=2）及骨（n=1）。19/21例患者纳入后续数据分析。我们呈现了CTC的全转录组图谱，并与转移灶及外周血进行了比较，所有样本均采集于IV期乳腺癌治疗前。多个基因，包括癌基因、乳腺上皮基因、间质基因及癌症干细胞基因，均呈现f

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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